股东出资纠纷管辖要综合考虑公司所在地等因素来确定管辖法院。《民事诉讼法》中管辖的相关规定即被告住所地或者出资协议履行地为基础，但要综合考虑公司所在地等因素来确定管辖法院。股东出资纠纷的表现很多：虚假出资纠纷、逾期出资纠纷、出资不足纠纷、抽逃出资纠纷等。因公司设立、确认股东资格、分配利润、解散等纠纷提起的诉讼，由公司住所地人民法院管辖。

依据我国相关法律的规定，公司因增加注册资本问题产生纠纷的，是属于民事纠纷的一种。

1、在实践中，公司主要办事机构一般是指公司董事会等重要机构。因为董事会是公司的经营管理决策机构，对外代表公司的。

2、在实践中，公司主要办事机构一般也指公司的主要营业地。主要办事机构，可能在登记地，也可能在营业地，而营业地可能有多个主要的营业地、次要的营业地。但是会出现如下问题：

（1）主要和次要营业地难以区分，主要营业地未必是主要办事机构所在地。这样往往会发生管辖异议。

（2）增加了原告的取证难度。原告起诉时必须去实地勘察营业地，并取得照片等初步证据。

3、登记地具有唯一性，一般以登记地为当然管辖地。

公司可以建立多处生产、营业场所，但是经公司登记机关登记的公司住所只能有一个，应当是在为其登记的公司登记机关的辖区内。营业地也可以管辖，对方提出管辖异议的，经查该营业地是主要办事机构所在地的，可以继续管辖，经查该营业地不是主要办事机构的，应当移送登记地管辖或主要办事机构所在地管辖。

一、股东出资纠纷的法律依据

《中华人民共和国民事诉讼法》第二十六条

因公司设立、确认股东资格、分配利润、解散等纠纷提起的诉讼，由公司住所地人民法院管辖。

第一百一十九条

起诉必须符合下列条件：

（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；

（二）有明确的被告；

（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；

（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。

第一百二十条

起诉应当向人民法院递交起诉状，并按照被告人数提出副本。书写起诉状确有困难的，可以口头起诉，由人民法院记入笔录，并告知对方当事人。