如果双方已经签字的话就协议而言已经生效，具有法律效力，如果有异议只能怪自己没有审慎对待，但如存在重大误解或受胁迫而签订的协议导致财产损失的话可以向法院提起诉讼。

一、拆迁补偿不公平申请行政诉讼的方法

1、起诉。起诉人在知道具体行政行为作出6个月内起诉。

2、审查受理。人民法院在收到起诉状后7日立案或裁定不予受理。

3、答辩。人民法院应当在立案之日起五日内，将起诉状副本发送被告；被告应当在收到起诉状副本之日起十日内向人民法院提交作出具体行政行为的有关材料，并提出答辩状；人民法院应当在收到答辩状之日起五日内，将答辩状副本发送原告。

4、开庭。宣读开庭秩序——法庭调查——法庭辩论——评议。

5、作出判决。

6、上诉。对于不服一审判决的，应当收到判决书后15日内向上一级人民法院上诉。

7、开庭审理或书面审理。

8、判决或裁定。依法改判或裁定撤销一身裁定、维持原判决或裁定、裁定发回重审。

9、申诉。

二、拆迁补偿不合理，但已签字怎么办

签了字协议就生效了，或有欺骗误导，你起诉到法院请求法院判令协议无效，你认为显失公平，彻销该协议。

农村集体土地上的房屋补偿标准，国家没有统一的补偿标准，原则是不得降低原有生活水平，短期生活有改善，长远生活有保证。同时要根据房屋的建筑结构和修建年代、地理位置和用途进行综合考量。还要结合政府的安置方式来区别计算。

按照产权置换的，应该给予合理面积和装修费补偿、搬迁费补助、过渡费；按照划地重建的，应该给予重置成新价补偿（本地修建原有规模房屋所需要的费用）、装修费和搬迁补助、过渡费；按照纯货币补偿的，应该给予附近城镇的商品房均价的补偿。

如果您觉得征收方补偿不公开，不透明，不合理，可以通过申请政府信息公开查看征收方的征地文件，通过行政复议或者行政诉讼维权。

《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十五条：房屋征收部门与被征收人依照本条例的规定，就补偿方式、补偿金额和支付期限、用于产权调换房屋的地点和面积、搬迁费、临时安置费或者周转用房、停产停业损失、搬迁期限、过渡方式和过渡期限等事项，订立补偿协议。

补偿协议订立后，一方当事人不履行补偿协议约定的义务的，另一方当事人可以依法提起诉讼。