可以。从法律角度上讲，分公司不具有独立的主体资格，它只是总公司的一个分支(其财产实际为总公司所有)，因此不是公司合并的问题(合并至少得两个公司)。关于“分公司的合并”，可以先将分公司注销，先由总公司做出分公司撤销的决议，总公司应当自决议作出之日起30日内向该分公司的公司登记机关申请注销登记。申请注销登记应当提交总公司法定代表人签署的注销登记申请书和分公司的《营业执照》。分公司注销后，申请住所变更登记。公司变更住所的，应当在迁入新住所前申请变更登记，并提交新住所使用证明。所以，在法律上分公司的合同较为简单。

但是最麻烦的是税务机关的合并，分公司的营业执照是非独立法人，但是地方的税务登记往往是按独立法人办理的，即以独立法人的核算纳税的，所以最大阻力是来自税务机关，要求其出具完税证明就行。各地的税务机关为了多纳税，注销一个分公司，就断了他一个财路，影响到财政收入，以具体的办理过程中可能遇到一些困难。

分公司注销流程具体如下：

1.注销登记在所属工商登记机关办理。

2.准备注销登记的相关材料。因为分公司不具备法人资格，注销登记材料应由所属公司做出决定并签署准备出具相关材料。材料应当提交原件，提交复印件的，应当注明“与原件一致”并由公司加盖公章。

3.材料准备完成后，向工商登记机关提交，在提交材料齐全、合法、有效的前提下，注销登记2个工作日内完成。

4.注销登记不收取任何费用。

5.分公司注销登记经工商登记机关核准后，公司应持《分公司注销登记核准通知书》到公司登记机关进行分公司撤销备案。同时，也要到技术监督局注销企业代码证。

分公司注销登记需要提交的材料

1.公司法定代表人、指定代表或者共同委托代理人签署并加盖公司公章的《分公司注销登记申请书》;

2.公司签署、加盖公司公章并粘贴指定代表或共同委托代理人身份证复印件的《指定代表或者共同委托代理人的证明》，应标明具体委托事项、权限、委托期限。指定代表或共同委托代理人要提交身份证原件(供当场确认使用)。

3.公司出具的注明分公司注销原因的注销决定。

4.分公司的《营业执照》正、副本。

5.分公司完税证明。

6.分公司如单独开设有银行账户的，还需提交银行清户证明。

7.分公司公章