一、公司有理由扣员工工资吗

公司有理由扣员工工资，但是不能随意扣员工的工资。缴纳个人所得税、应由劳动者个人负担的各项社会保险费用、法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费等，都是可以从员工的工资中扣的。

《工资支付暂行规定》第十六条

因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

二、公司无故扣我工资怎么处理

工作过程中要是遇到用人单位无故克扣工资的情况，可以向单位所在地的劳动行政部门进行投诉，按照规定劳动行政部门是会责令单位及时补足克扣的工资，当然还可以格外要求单位作出相应的赔偿。若是这种投诉无法解决的话，还可以申请劳动仲裁或者提起劳动诉讼。

《劳动合同法》第八十五条

用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：（一）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的；（二）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；（三）安排加班不支付加班费的；（四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。

三、公司恶意扣除员工工资怎么处理

公司恶意扣除员工工资的处理方法具体如下：

1、劳动者因被扣除工资发生争议时，应先向用人单位提出支付的要求，主动与用人单位沟通协商。

一般来说，多数用人单位会考虑到诉讼成本和造成的负面影响，会同意支付合理工资的要求。在双方达成一致意见后，劳动者可与用人单位签订和解协议，但要注意该协议并无强制执行力。

2、在劳动争议发生后，劳动者可向劳动争议调解委员会提出请求，要求其主持调解。该劳动争议调解委员会一般由职工代表、用人单位代表和工会代表组成，可相对中立的协助双方化解矛盾；

也有利于减少双方诉累。因此，当因被拖欠工资发生争议时，劳动者可先考虑此种方式。若双方达成一致意见，可由劳动争议调解委员会制作调解协议，但该协议也无强制执行力。

3、在无法与用人单位协商或者经协商仍无效时，劳动者可以在劳动关系终止之日起1年内，向用人单位所在地或者劳动合同履行地的劳动争议仲裁委员会提起仲裁。

与上述方式不同，劳动仲裁是解决劳动争议的必经途径，即在依靠上述几种方式均无法要回工资时，下一步必经劳动仲裁。仲裁开庭前会安排调解，此时制作的调解书具有强制执行力。

一般来说，因拖欠劳动者工资报酬引发的争议，对于用人单位来说是一裁终局的。

4、如果劳动者对劳动仲裁的结果不满意，可以在收到仲裁裁决书之日起15天之内，向仲裁机构所在地法院起诉。也就是说，劳动者如果未能获得满意的结果；

比如没要到工资，或者工资给的少，是有一次救济途径的，即可通过诉讼形式补救一次。而用人单位仅能在具备法定情形时，才能向法院申请撤销仲裁。此项规定体现出了法律对弱势群体的保护。

《劳动争议调解仲裁法》第五条

发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；

不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。

《中华人民共和国劳动合同法》（2012修正）：第七章　法律责任　　第八十五条　【未依法支付劳动报酬、经济补偿等的法律责任】用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：\n（一）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的；\n（二）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；\n（三）安排加班不支付加班费的；\n（四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。