病假期间基本工资和绩效两部份都扣，扣后余额不低于当地最低工资80%合法。

一、根据原劳动部《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》第五十九条规定

职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期内由企业按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。

同时，根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》的相关规定，医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治疗休息不得解除劳动合同的时限。

二、企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期：

(一)实际工作年限十年以下的，在本单位工作年限五年以下的为三个月；五年以上的为六个月。

(二)实际工作年限十年以上的，在本单位工作年限五年以下的为六个月；五年以上十年以下的为九个月；十年以上十五年以下的为十二个月；十五年以上二十年以下的为十八个月；二十年以上的为二十四个月。

医疗期三个月的按六个月内累计病休时间计算；六个月的按十二个月内累计病休时间计算；九个月的按十五个月内累计病休时间计算；十二个月的按十八个月内累计病休时间计算；十八个月的按二十四个月内累计病休时间计算；二十四个月的按三十个月内累计病休时间计算。企业职工在医疗期内，其病假工资、疾病救济费和医疗待遇按照有关规定执行。

用人单位支付给劳动者的工资就不得低于当地最低工资标准。而且，延长工作时间的工资，中班、夜班、高温、低温、井下、有毒有害等特殊工作环境、条件下的津贴，还有法律、法规和国家规定的劳动者的非货币性收入，如福利待遇和依法缴纳的社会保险、住房公积金等均不属于工资范围，不包括在最低工资内。所以，劳动者在试用期间，单位也要执行最低工资标准。在一个月工资支付周期内，劳动者在法定的工作时间内未提供正常劳动，如果不是由本人原因造成的，用人单位也应按照不低于最低工资标准，向劳动者支付工资。