会。但是法院不能直接退回公安机关补充侦查。如果检察院不主动申请撤回，那么法院只能依法作出证据不足，起诉的犯罪不能成立的无罪判决。除非是在一审判决作出前，提起公诉的检察院向法院申请撤回起诉进行补充侦查经法院裁定准许后才可以，检察院不主动申请，法院是不能决定退回的。

一、检察院批捕之后的流程

检察院批捕后，公安机关继续刑事侦查。1、对犯罪嫌疑人逮捕后的侦查羁押期限不得超过二个月。案情复杂、期限届满不能终结的案件，可以经上一级人民检察院批准延长一个月。2、公安机关侦查终结的案件，应当做到犯罪事实清楚，证据确实、充分，并且写出起诉意见书，连同案卷材料、证据一并移送同级人民检察院审查决定。3、人民检察院对于公安机关移送起诉的案件，应当在一个月以内作出决定，重大、复杂的案件，可以延长半个月。4、人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。5、人民检察院认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，应当作出起诉决定，按照审判管辖的规定，向人民法院提起公诉。6、人民法院审理公诉案件，应当在受理后一个月以内宣判，至迟不得超过一个半月。

二、证据不足怎么办

事实不清证据不足人民法院一般会作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决，当庭宣告判决的，应当在五日以内将判决书送达当事人和提起公诉的人民检察院；定期宣告判决的，应当在宣告后立即将判决书送达当事人和提起公诉的人民检察院。

三、刑诉法对刑事诉讼程序的规定是什么呢

根据《刑事诉讼法》规定，刑事诉讼的程序如下：

一、检察院审查起诉。一般对于刑事案件检察院审查起诉的期限为一个月，对于重大、复杂的案件，可以延长十五日。

二、法院安排开庭审理。

三、法院作出判决。法院经过庭审后应该根据情况作出以下判决：

（一）案件事实清楚，证据确实、充分，依据法律认定被告人有罪的，作出有罪判决；

（二）依据法律认定被告人无罪的，作出无罪判决；

（三）证据不足，不能认定被告人有罪的，作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。