分为两种不同情况：

一、小产权房的性质是属于履行了审批手续的房屋，但是集体经济组织在安置本集体村民过程中擅自扩大了销售对象。由于根据现行法律和政策，非本集体经济组织的成员，不得购买在集体所有的土地上建设的房屋，因此买卖合同归于无效。在此情况下，应首先认定所涉房屋的所有权是属于农村集体经济组织所有，或者属于宅基地使用人所有，拆迁安置补偿的利益，只能由所有权人即集体经济组织及其成员享有。

二、小产权房是属于违法建筑。对于这种情况，根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第第二十四条“市、县级人民政府及其有关部门应当依法加强对建设活动的监督管理，对违反城乡规划进行建设的，依法予以处理。市、县级人民政府作出房屋征收决定前，应当组织有关部门依法对征收范围内未经登记的建筑进行调查、认定和处理。对认定为合法建筑和未超过批准期限的临时建筑的，应当给予补偿；对认定为违法建筑和超过批准期限的临时建筑的，不予补偿。”的规定。若涉及赔偿，但标准和持国有土地使用证住房会有很大的差别。国有使用证的取得费用中包含了土地出让金，其中包含有征地补偿费、安置补助费、地上附着物补偿、国土收益等。在政府拆迁中会将这部门费用根据使用年限计算，而小产权房遇到补偿时只会支付征地补偿费和安置补偿费，且这个费用很大一部分要归集体经济组织所有。而房产补偿（也就是附着物补偿）适用标准也不同于国有证住房。

小产权房屋拆迁怎么补偿？

小产权房被拆除，一般不会进行补偿。小产权房是指在农村集体土地上建设的房屋，未办理相关证件，未缴纳土地出让金等费用，其产权证不是由国家房管部门颁发，而是由乡政府或村颁发的房屋。小产权房在本质上仍然属于违法建筑。政府将其进行拆除属于行使行政职权，因此对于房屋使用人无赔偿。

《国有土地上房屋征收与补偿条例》

第二十四条市、县级人民政府及其有关部门应当依法加强对建设活动的监督管理，对违反城乡规划进行建设的，依法予以处理。

市、县级人民政府作出房屋征收决定前，应当组织有关部门依法对征收范围内未经登记的建筑进行调查、认定和处理。对认定为合法建筑和未超过批准期限的临时建筑的，应当给予补偿；对认定为违法建筑和超过批准期限的临时建筑的，不予补偿。