公司有诉讼的，一般不可以注销。公司要经依法清算后，才能向公司登记机关申请办理注销登记。所以在公司进行诉讼时，权利义务关系尚未明确，公司的清算组也不能准确的确定公司的资产和债权债务情况，暂时不能进行注销。

一、公司股东会决议注销要注意什么

公司股东会决议注销要注意以下事项的：1、公司股东会决议注销的，要从决议作出之日起15日内，成立清算组进行清算，有限责任公司的清算组由股东组成，股份有限公司的清算组由董事或者股东大会确定的人员组成；2、清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，应当制定清算方案，然后报股东会确认的；3、清算报告经过股东会确认后，应当报送公司登记机关，办理注销登记。

二、公司解散程序怎么做？

公司解散需要经过如下四个流程：1.成立清算组清算组的成立分如下三种情形第一，公司主动解散。即因公司章程规定的营业期限届满或者公司章程规定的其他解散事由出现时，或者股东会决议解散时，应当在15天内成立由全体股东组成的清算组。第二、债权人申请解散。若将解散的公司超过15日不成立清算组进行清算的，债权人可以申请人民法院指定有关人员组成清算组。第三、被迫解散。公司因违反法律、行政法规而被依法责令解散或者因为撤销许可而解散时，由有关主管机关组织股东、有关机关及有关专业人员组成清算组。2、通知债权人清算组应当在成立之日起10日内通知债权人，并于60日内在报纸上至少公告3次；债权人应当在接到通知书之日起30日内向清算组申报其债权。3、注销登记清算组结束工作之后，将股东会及有关机关确认的清算报告报送公司登记机关，申请注销公司登记。4、公告公司终止公司注销登记后，在本公司所在地发布公司解散公告。

三、深圳公司注销程序

公司注销是指当一个公司宣告破产，被其它公司收购、规定的营业期限届满不续、或公司内部解散等情形出现时，公司需要到登记机关申请注销，以终止公司法人资格的过程。公司到登记机关办理公司注销程序之前一定要依法进行清算，包括终止生产经营销售活动、了结公司事务、了结民事诉讼、清理债权和债务以及分配剩余财产等。公司不论是何性质的清算，均应当依下列步骤展开：1、成立清算组。2、展开清算工作。清算组的工作包括：接管公司财产、了结公司业务、收取债权、清理债务、分配剩余财产、注销公司法人资格并吊销营业执照。3、通知债权人申报债权。4、提出清算方案。清算方案的主要内容包括：清算费用、应支付的职工工资和劳动保险费用、应缴纳的税款、清偿公司债务、分配剩余财产、终结清算工作。在清算工作完成后，才能进行注销。