一般来说商铺办理房产证需缴纳的交易费用有：交易手续费、登记费、核档费、营业税、个人所得税、契税。各城市的缴纳费用标准会有差异，具体缴纳费用需联系当地房管局。

1、契税：按房屋交易额5％缴纳。（买方承担）

2、销售不动产营业税：按房屋交易额5．5％缴纳。（卖方承担）

3、土地增值税：按房屋交易额1％缴纳。（卖方承担）

4、个人所得税：按房屋交易额1％或房屋现值－房屋原值差额20％缴纳。（卖方承担）

5、印花税：按房屋交易额万分之十缴纳。（买卖双方各承担一半）

6、房屋产权登记费：550．00元。（买方承担）

7、房屋交易手续费：按房屋交易额1．9％缴纳。（买卖双方各承担一半）

法律依据：

《中华人民共和国个人所得税法》第三条个人所得税的税率：

（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率；

（二）经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率；

（三）利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。

一、商铺办理房产证需提交哪些材料

1、房屋登记申请书

2、工商营业执照或组织机构代码证

3、代理人身份证复印件

4、国有土地使用证

5、建设工程规划许可证及其附件

6、建设工程规划验收合格证

7、建筑工程竣工验收备案证

8、人防工程联系单和验收单（有地下室的房屋提供，核对原件收取复印件）

9、房地产开发企业资质证书

10、经由市房管局审核通过的房屋测绘报告

11、新建房屋白蚁预防工程证书、武汉市商品住宅维修基金缴款凭证、武汉市房地产开发项目竣工交付使用备案证

12、开发企业出售房屋和全体业主共有房屋明细表及相应证明材料

二、房产证办理流程怎么走

1、买卖双方进行房产交易后一个月内持房屋买卖合同和其他证件到房地产交易所办理买卖过户登记；

2、买卖双方接到交易所办理过户手续的通知后，应携带身份证、户口本、图章等，在交纳了手续费、契税、印花税后就可以办理过户手续；

3、办理完买卖过户手续后，买方应持房地产交易所发给的房产卖契，在三个月内到房屋所在地的市或区（县）的房屋土地管理局登记申请。办理申请需要的证件和资料有：卖方所有的整栋楼的房屋所有权证、《商品房购销合同》、商品房销售发票存根复印件、身份证复印件、《房屋所有权转移登记表》、《墙界表》、《面积计算表》；

4、经房地产管理部门审查验证后，买方可领取房地产权证。