根据我国的相关法律规定，商标专用权质押登记机关是国家工商行政管理局。国家工商行政管理局商标局具体办理商标专用权质押登记。 商标权质押登记程序：

（一）登记申请 自然人、法人或者其他组织以其注册商标专用权出质的，出质人与质权人应当订立书面合同，并向商标局办理质权登记。质权登记申请应由质权人和出质人共同提出。质权人和出质人可以直接向商标局申请，也可以委托商标代理机构代理。

（二）延期申请 因被担保的主合同履行期限延长、主债权未能按期实现等原因需要延长质权登记期限的，质权人和出质人双方应当在质权登记期限到期前，持有关文件申请办理延期登记。

（三）注销申请 商标专用权质权登记需要注销的，质权人和出质人双方可以持有关文件办理注销申请。 《商标法》第三十七条规定：“注册商标的有效期为10年，自核准注册之日起计算。”《商标法》第三十九条限定，“转让注册商标经核准后，予以公告。受让人自公告之日起享有商标专用权”。

一、办理商标专用权质押登记申请程序

（一）商标专用权质押登记的申请人：

1、商标专用权质押合同登记的申请人，应是订立商标专用权质押合同的出质人与质权人。

2、申请商标专用权质押合同登记，一般由签订合同的双方当事人向商标局办理质押登记申请手续。

3、申请商标专用权质押登记，可以直接办理，也可以委托他人代理委托。委托他人代理的，应当交送代理人委托书一份，代理人委托书应当载明代理内容和权限。

（二）办理商标专用权质押合同登记申请：

申请商标专用权质合同登记需提交下列文件：

1、填写的《商标专用权质押登记申请书》，其申请书应包括以下内容：

（1）申请质押原因，

（2）申请质押登记的双方当事人名称、法人代表、地址并加盖申请人章戳，

（3）质押商标名称、注册证号，商标有效期，

（4）质押商标的权属状况，

2、质押的价值，质押的期限等；

3、企业营业执照（复印件）；

4、主合同和质押合同复印件（外文文本需附中文译本1份）；

5、质押商标所有权证明原件或经核对的复印件（包括续展、变更、转让情况）：

6、代理人权限委托书；

7、商标局认为应当提交的其它文件或材料。

（三）申请登记的时间要求和审查期限：

出质人与质权人应当于订立书面协议之日起20日内，向国家工商行政管理局商标局申请登记；

登记机关应于受理登记申请之日起5个工作日内，作出是否予以登记的决定。

符合上述登记条件的，商标局予以登记，发给《商标专用权质押登记证》；不符合有关规定的（如：出质人不是商标权合法所有人的；商标权归属不明确的；没有缴纳登记费等），商标局不予登记。

（四）有下列情形之一的，登记机关将撤销登记：

1、登记后发现与事实不符的；

2、登记后发现有不应予以登记事由的；

3、登记后发现质押合同无效的；

4、双方当事人申请撤销的。

二、商标专用权质押登记费用

商标专用权质押是指商标注册人以债务或者担保人身份将自己所拥有的、依法可以转让的商标专用权作为债权的担保，当债务人不履行债务时，债权人有权依照法律规定，以该商标专用权折价或以拍卖、变卖该商标专用权的价款优先受偿。商标专用权质押登记费用每个城市公证处收费都不一样的。一般价格在400－500左右。