熟人强奸案证据不足的处理方式有：

1、公安机关认为证据不足的可以补充侦查；

2、人民检察院认为证据不足的，可以要求公安机关补充侦查，也可以自行侦查；

3、人民法院依法审理，认为证据不足的，应当作出证据不足的无罪判决。

一、刑事立案后侦查期间多长时间

刑事案件立案后的侦查时间是怎么规定的

根据《刑事诉讼法》第一百一十五条规定，公安机关对已经立案的刑事案件，应当进行侦查，收集、调取犯罪嫌疑人有罪或者无罪、罪轻或者罪重的证据材料。对现行犯或者重大嫌疑分子可以依法先行拘留，对符合逮捕条件的犯罪嫌疑人，应当依法逮捕。可见，刑事案件立案后需要对许多环节进行侦查。

1、强制措施期限

(1)传唤、拘传持续时间不得超过12小时;

(2)拘留时间，一般不得超过14日，特殊情况最长37天;

(3)取保候审时间，不得超过12个月;

(4)监视居住时间，不得超过6个月。

2、侦查羁押期限

(1)对犯罪嫌疑人逮捕后，不得超过2个月;

(2)案情复杂、期限届满不能终结的案件，可以延长1个月;

(3)对符合刑事诉讼法第126条规定情形的，可以延长2个月;

(4)对犯罪嫌疑人可能判处10年有期徒刑以上刑罚的，依照刑事诉讼法第126条延长期限届满，仍不能侦查终结的，可以再延长2个月;

(5)发现另有重要罪行的，重新计算期限。

审查起诉阶段的补充侦查

1、补充侦查的形式。根据刑事诉讼法第140条第2款的规定，人民检察院审查起诉的案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查;也可以自行侦查，必要时可以要求公安机关提供协助。

2、补充侦查的期限和次数。根据刑事诉讼法第140条第3款的规定，对于补充侦查的案件，应当在1个月以内补充侦查完毕，补充侦查以两次为限。这既指退回公安机关补充侦查的案件，也包括人民检察院自侦案件中决定退回补充侦查的案件。

3、经过一次退回补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定。如果案件经过两次退回补充侦查，仍然证据不足，不符合起诉条件的，人民检察院应当作出不起诉决定。

刑事案件的侦查有一定的期限，一般不得超过2个月。公安机关对已经立案的刑事案件，应当进行侦查，收集、调取犯罪嫌疑人有罪或者无罪、罪轻或者罪重的证据材料。

二、案子证据不足应该怎么样处理

案子证据不足的处理方法为：1、如果人民检察院在审查案件过程中认为案件证据不足，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，或者也可以自行侦查，补充侦查最多两次；2、如果已经经过二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，那么人民检察院应当作出不起诉的决定。

三、补充侦查补充侦查可以改口供吗

补充侦查可以改口供。人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。补充侦查以二次为限。对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。