一、如何确认股权转让所得？

股权转让是企业转让其持有的股权的行为，而这个行为给企业带来的结果就是获取股权转让所得（或损失）。按照相关规定，企业股权转让所得属于转让财产所得，应以其股权转让收入扣除为取得该股权所发生的成本后的余额为股权转让所得。

1、允许扣除的股权成本为企业投资时实际交付的出资金额。

对此，国税函[2009]698号《关于加强非居民企业股权转让所得企业所得税管理的通知》中规定：股权成本价是指股权转让人投资入股时向中国居民企业实际交付的出资金额，或购买该项股权时向该股权的原转让人实际支付的股权转让金额。

2、股权转让收入不得扣除被投资企业留存收益中所可能分配的金额。

关于投资企业享有的被投资企业留存收益的份额究竟能否在转让收入中扣除的问题，原内资、外资企业所得税法的规定并不相同。在2008年颁布了新《企业所得税法》后，总局对这一问题的口径终于统一，并在国税函[2010]79号文中予以明确，即：企业在计算股权转让所得时，不得扣除被投资企业未分配利润等股东留存收益中按该项股权所可能分配的金额。也就是说，在股权转让中，没有实际分配的留存收益不能作为免税收入予以扣除。这一结论也与《关于加强非居民企业股权转让所得企业所得税管理的通知》（国税函[2009]698号）中论调一致，即：如被持股企业有未分配利润或税后提存的各项基金等，股权转让人随股权一并转让该股东留存收益权的金额，不得从股权转让价中扣除。

二、股权转让纳税义务发生时间是什么时候？

根据国税函[2010]79号文规定：企业转让股权收入，应于转让协议生效、且完成股权变更手续时，确认收入的实现。也就是说完成股权变更手续是确认收入实现的必要条件。

企业取得财产（包括各类资产、股权、债权等）转让收入、债务重组收入、接受捐赠收入、无法偿付的应付款收入等，不论是以货币形式、还是非货币形式体现，除另有规定外，均应一次性计入确认收入的年度计算缴纳企业所得税。即除税法另有规定外，对于股权转让收入均应一次性计入确认收入的年度计算所得税，而不得分期确认收入。

三、如何确认扣除股权转让损失？

既然股权转让是企业转让财产的一种行为，那么自然也会出现股权转让损失。《关于企业股权投资损失所得税处理问题的公告》（国家税务总局2010年第6号公告）的出台，对这一问题有了明确：企业对外进行权益性（以下简称股权）投资所发生的损失，在经确认的损失发生年度，作为企业损失在计算企业应纳税所得额时一次性扣除。即企业可以在损失发生年度一次性确认损失予以税前扣除。