1、这类合同特别要注意审查合同总额或称工程总价和款项支付条款之间的联系，别要注意是否有对工程款的审计的条款。有些合同在工程概况条款中约定了合同总额，该数额是确定的，但在付款条款中又约定了经审计后再付款，显然，这样的合同条款是相互矛盾的，因当在合同总额中写明是暂定数额，具体款项案审计结果确定。

2、工程类合同涉及大量的合同附件，要注意与合同的相关条款的一致性。

3、竣工验收条款和付款条款是紧密联系的，因此要注意审查竣工验收条款。此外，竣工验收又关系到交付、保修期等。

4、注意违约责任的约定，特别要注意到工期延误、因工程质量问题造成无法验收时的违约责任等。

5、对于经过招投标程序的，还需要审查有关的招投标文件与合同约定是否相符。

一、施工合同备案由谁办理

根据《中华人民共和国建筑法》第三十一条规定，（合同备案）发包单位应当在建设工程合同签订的30日内，送工程所在地建设行政主管部门备案。

合同发生重大变更的，发包单位应自合同变更后15个工作日内，将变更协议送原备案机关备案。

同时，根据《房屋建筑和市政基础设施工程施工招标投标管理办法》（建设部第89号令）第47条规定订立书面合同7日内，中标人应当将合同送县级以上建设行政主管部门备案；在施工过程中，各级政府建设工程质量监督管理部门还要对工程建设的质量进行全面监督。日常中施工合同备案是由建设单位办理的，但也存在双方一同办理备案的情况。

二、工程施工合同扰民该怎么办

施工前充分考虑、评估施工扰民的程度与后果，采取必要工程技术措施尽量减少扰民，并划拨合理的补偿经费。进场施工前，应提前通告，并与可能会受到影响的村集体、居委会、业主委员会与居民进行有诚意的沟通与协商。

确定补偿标准与签订补偿协议时，最好取得所在村集体、居委会、业主委员会的理解与支持，并在这些组织的配合下签订协议、发放补偿金。补偿标准的确定应当考虑到当前的生活水准与物价，在法定标准上予以提高，以尽量满足居民的合理要求。在因居民受影响程度不一且无法采取统一补偿标准的情况下，为了防止居民互相攀比、毁约变卦，可以采取一对一协商的方式，必要时在补偿协议中加入保密条款。通过这些事前的预案与措施，可以将产生扰民纠纷的风险降到最低，从而避免在纠纷发生后再采取补救措施所可能要付出的高昂成本。