可以申请法院执行，但只限于查封。

1、小产权房原始所有人(即“大产证所有人”)违法是可以被法院查封的。

2、小产权房其他居住人违法是无法被法院查封的，(1)小产权房是法律所禁止出售的房屋;(2)小产权房无法办理房产证;(3)居住人虽然花钱购买了房屋，但是无法办理产证，因此也就无法确认其所有权，故法院就难以查封的;(4)但是，原始所有人是可以被查封的，因为有其房产证。什么情况下法院会查封房屋?法院查封房产的情形包括：(1)恶意转移、变卖房产;(2)诉前保全;(3)执行案件中，暂无履行能力或其他可供执行财产的。

一、无法办理房产证的情况

1、交易受限的房子

对于交易受限的房子可能很多购房者还不太了解，比如说被抵押的房子和经济适用房，经济适用房是具有社会保障性质的住房，其推出目的是解决民众住房问题而不支持交易。如果购买经济适用房的购房者想要上市交易的话，那么也只能在购买经适房满五年后，否则无法办理房产证。因此，购买二手房之时，如果该房子是经适房，需查看是不是在交易限制期内。

2、小产权房

小产权的房屋相信大家都有所了解，农村集体土地上建设的房屋就是小产权房，小产权房屋未缴纳土地出让金等费用，其产权证没有国家颁发的正规房地产权证，只有乡政府或村政府颁发的证书，亦称“乡产权房”。按照国家的相关要求，“小产权房”不得确权发证，不受法律保护。

3、房屋验收不合格

一般来说，开发商在楼盘竣工后都是需要经过相关部门来进行验收的，如果楼盘验收不合格的话，开发商需要整改，整改后依旧不合格的，无法将房交给购房者，更无法办理房屋所有权证。

4、开发商违规建房

虽然违建房在房产交易市场中并不常见，但是这不代表不存在开发商违建的情况，如果开发商在建造房屋的过程中擅自改变土地使用用途，将会直接导致交房后你拿不到房产证的后果。因此，决定购房之前，审查开发商资质非常重要，保险的做法就是选择知名楼盘和有实力的开发商，深入调查后再购买，这样才更加可靠。

二、什么叫小产权房,购买小产权房有哪些法律风险

小产权房是指在农村集体土地上建设的房屋，未缴纳土地出让金等费用，其产权证不是由国家房管部门颁发，而是由乡政府或村政府颁发，亦称乡产权房。

购买小产权房的法律风险：

1、无法取得房屋所有权；

2、不能办理房产证；

3、不能上市交易；

4、可能被强制拆除或没收。