保护改制企业小股东的合法权益的方法是，保护其知情权，使其可以查阅公司账簿，了解公司的财产情况。在作出重大决议时应当倾听小股东的意见。小股东也是具有表决权的。

一、股东查账权到底该怎么操作

小股东查账首先应当对于公司提出申请，被公司拒绝的，公司应当出具书面说明。被拒绝的股东可以起诉公司侵犯其知情权。查账权是指股东可以查阅并复制董事会会议决议、监事会会议决议、复制股东会会议记录以及财务会计报告。

二、大股东不分红,小股东怎么办

小股东可以自己协商，也可以由专业人士协商。小股东可以要求审计，如果对方拒绝，可以向法院起诉，法院起到敲山震虎的作用。公司不回购股权的，大股东不接受小股东的股权转让，小股东将股权转让给股东以外的第三方，无人接受。此时，小股东们悬而未决，无能为力。中小股东要保护自己的合法权益，必须付出巨大的代价。

三、股东怎样维护自身的利益

1、小股东拥有知情权。股东有权了解公司经营状况、财务状况等信息，包括查阅、复制公司章程、股东会会议记录、董事会会议决议、监事会会议决议和财务会计报告。股东还可以要求查阅公司会计账簿。若小股东遇到阻挠，经法定程序后，可以向法院提起知情权诉讼。2、股东派生诉讼。当公司的合法权益受到他人侵害，特别是受到有控制权的股东、母公司、董事和高级管理人员等的侵害而公司怠于行使诉权时，符合法定条件的股东(连续180日以上单独或者合计持有公司1%以上股份的股东)以自己名义为公司的利益对侵害人提起诉讼，追究其法律责任，间接地保护了自己的合法权益。3、股东拥有股利分配请求权。当公司有可供分配的盈余时，控股股东以各种理由不正当地拒绝派发盈余或者过分提取任意公积金而损害股利分配权。大股东往往担任公司高管，可以通过薪水、奖金获得回报，小股东则被排除在管理层之外，无法获得任何利益。小股东可以请求按照自己的持股比例分配股利，但提起诉讼，要以股东会已通过分配决议或者在公司章程中已约定的盈余分配方案为前提。4、小股东行使退股权。有下列情形之一的，对股东会该项决议投反对票的股东可以请求公司按照合理的价格收购其股权;若公司拒绝的，股东可以提起请求收购股份诉讼：(一)公司连续五年不向股东分配利润，而公司该五年连续盈利，并且符合本法规定的分配利润条件的;(二)公司合并、分立、转让主要财产的;(三)公司章程规定的营业期限届满或者章程规定的其他解散事由出现，股东会会议通过决议修改章程使公司存续的。5、请求解散公司。单独或者合计持有公司全部股东表决权百分之十以上的股东，当公司陷入僵局，经营管理发生严重困难或者控股股东压制小股东，严重影响小股东利益时，股东可以提起解散公司的诉讼，在法院判决后，在按照有关规定进行清算分配。