宅基地使用费的核算方法：

1、每户宅基地使用面积按实际占用数量累计计算。

2、对超出用地标准多占的宅基地可采取分段累进递增的收费办法。

3、对不符合申请使用宅基地条件而立户用宅基地的，按超标计费。

4、户口不在本村而使用宅基地的按超标计费。

5、烈士家属、二等以上残废军人、五保户、扶贫对象以及领取独生子女证的生活特殊困难户，在用地标准以内的宅基地，由个人提出申请，经村民代表讨论同意，村民委员会审查批准，其宅基地使用费可定期减、免。超过用地标准的部分，仍按超标计费。

6、新批准使用的宅基地，免收当年宅基地使用费。

7、宅基地使用费每年收取一次。使用宅基地的农户应按村委会规定的时间，向本村委会缴付使用费。逾期不交的，按日加收滞纳金，日加收标准一般不超过应缴宅基地使用费总额的1%。各乡(镇)土地管理所(站)，应按规定向所在区、县物价局办理核发收费许可证手续。

8、各区、县人民政府可根据本地区集体经济状况，具体规定宅基地使用费留村及上缴比例，其上缴区(县)乡(镇)部分，一般不超过每年实际收取宅基地使用费总额的10%，最高不得超过15%。宅基地使用费留村部分，主要用于村内基础设施和公益事业建设;上缴部分作为区(县)、乡(镇)土地管理部门推动宅基地有偿使用工作专项经费，用于开展业务、技术培训、宣传、会议和添置必要设备等。宅基地使用费要单设帐户，存入银行、专款专用，严格控制使用范围。村使用时，需由村委会做计划提出申请，经乡(镇)人民政府批准;乡(镇)土地管理所(站)使用时，需报区(县)土地管理部门批准。

9、宅基地使用费收缴、开支情况要向群众及时公布、接受群众监督。区(县)土地管理部门要会同同级财政、物价部门对宅基地使用费的收缴、管理、使用情况进行监督检查，发现问题及时纠正。对不按规定用途使用的，要限期退回，并对主要责任者给予批评教育;对侵吞使用费的个人，除责令退回外，并视情节轻重给予行政处分;构成犯罪的要追究刑事责任。

10、各区、县人民政府应根据有关文件和本补充意见，结合本地区实际情况，制订试点工作实施细则。