两个以上行政机关对行政处罚都有管辖权的关系看具体情况。

一、一般有以下几种情况：

1、如果争议各方是同一政府所属的两个以上工作部门，行使指定管辖权的机关就是本级人民政府，如：县工商局和县物价局之间发生行政处罚管辖权争议，指定管辖机关就应该是该县人民政府。

2、如果争议各方是不同级政府所属的两个以上工作部门，则需要具体问题具体分析，如果这两个以上部门都隶属于同一个行政主管部

门，就由这个行政主管部门指定即可，如：同一个省的一市一县工商局对一违法案件发生争议就应当由省工商局指定管辖；如果两个以上的部门不属于同一个行政主管部门，则应当由他们共同的上级人民政府指定，如：同一个省一个市的交通局和另一个市的公安局发生行政管辖争议，应当由省级人民政府作出指定管辖决定。

3、如果争议各方是两个以上人民政府，如：同一个市所属的两个县政府对行政处罚管辖发生争议，这个市人民政府就可以对该行政处罚案件作出指定管辖决定。

二、行政处罚的管辖规定如下：

1、行政处罚由违法行为发生地的行政机关管辖。

2、行政处罚由县级以上地方人民政府具有行政处罚权的行政机关管辖。

3、两个以上行政机关都有管辖权的，由最先立案的行政机关管辖。两个以上依法享有行政处罚权的实施机关如对同一行政违法案件都有管辖权，在案件管辖上发生争议，双方又协商不成的，应报请共同的上一级行政机关指定管辖。

4、对行政违法案件有管辖权的行政机关若发现相应违法行为构成犯罪的，行政机关必须依法及时将案件移送司法机关，依法追究刑事责任。违法行为经人民法院依法审判认定构成犯罪判处拘役或有期徒刑时，行政机关已经给予当事人行政拘留的，应当依法折抵相应刑期。违法行为构成犯罪，人民法院判处罚金时，行政机关已经处以罚款的，应当折抵相应罚金。

《中华人民共和国行政处罚法》第二十五条

两个以上行政机关都有管辖权的，由最先立案的行政机关管辖。

对管辖发生争议的，应当协商解决，协商不成的，报请共同的上一级行政机关指定管辖；也可以直接由共同的上一级行政机关指定管辖。