商标许可费的支付方式有以下几种：一次性支付或分期支付。付费的标准可以一次协商一个总数，也可以按照产品的产量或利润提成。一次全部支付许可费的方式对许可人非常不利，除非被许可人实力雄厚。另外一次性风险过大，一旦商标不能带来利润将血本无归。相对来说提成的方式比较可取，一方面不会占用太多资金，另外也便于根据商标的实施情况随机应变。

一、商标使用许可合同未备案如何处罚

商标使用许可合同未备案如何处罚法律并未明确规定。但是《中华人民共和国商标法》第四十三条规定，商标使用许可未经备案不得对抗善意第三人。

商标注册人可以通过签订商标使用许可合同，许可他人使用其注册商标。许可人应当监督被许可人使用其注册商标的商品质量。被许可人应当保证使用该注册商标的商品质量。

经许可使用他人注册商标的，必须在使用该注册商标的商品上标明被许可人的名称和商品产地。

《商标使用许可合同备案办法》

第四条商标使用许可合同自签订之日起三个月内，许可人应当将许可合同副本报送商标局备案。

第五条向商标局办理商标使用许可合同备案事宜的，可以委托国家工商行政管理局认可的商标代理组织代理，也可以直接到商标局办理。

许可人是外国人或者外国企业的，应当委托国家工商行政管理局指定的商标代理组织代理。

第七条申请商标使用许可合同备案，应当提交下列书件：

（一）商标使用许可合同备案表；

（二）商标使用许可合同副本；

（三）许可使用商标的注册证复印件。

人用药品商标使用许可合同备案，应当同时附送被许可人取得的卫生行政管理部门的有效证明文件。

卷烟、雪茄烟和有包装烟丝的商标使用许可合同备案，应当同时附送被许可人取得的国家烟草主管部门批准生产的有效证明文件。

外文书件应当同时附送中文译本。

第八条商标注册人通过被许可人许可第三方使用其注册商标的，其商标使用许可合同中应当含有允许被许可人许可第三方使用的内容或者出具相应的授权书。

第九条申请商标使用许可合同备案，应当按照许可使用的商标数量填报商标使用许可合同备案表，并附送相应的使用许可合同副本及《商标注册证》复印件。

商标使用许可合同是否必须备案

根据《商标法》规定，商标许可人应当在签订商标使用许可合同之日起规定期限内，将以下文件报送商标局备案：

（1）由许可人和被许可人共同签署的《商标使用许可合同》原件；

（2）由许可人和被许可人共同签署的《商标许可合同备案表》；

（3）《商标注册证》复印件；

（4）被许可人的《营业执照》或副本复印件。

二、商标使用许可诉讼怎么提起

根据《最高人民法院关于审理商标民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》第四条第二款的规定，在发生注册商标专用权被侵害时，独占使用许可合同的被许可人可以向人民法院提起诉讼；排他使用许可合同的被许可人可以和商标注册人共同起诉，也可以在商标注册人不起诉的情况下自行提起诉讼；普通使用许可合同的被许可人经商标注册人明确授权，可以提起诉讼。

独占许可毕竟不同于转让，商标注册人仍然可以向人民法院提起诉讼。

根据《最高人民法院关于审理商标民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》第三条的规定，《商标法》第四十条规定的商标使用许可包括以下三类：独占使用许可、排他使用许可和普通使用许可。