（一）立案

税务机关对受理的税务案件，都要听取知情人和有关单位及群众的意见，根据违章情况确定查处办法。

1、对违章事实比较清楚、情节轻微、数额较小、不需要组织调查即可定性的税务案件，可不立案。

2、对违章行为比较严重、情节恶劣、案情复杂、数额较大、涉及面广、影响较大、需要组织调查处理的税务案件，均应立案。具体立案标准，由省、自治区、直辖市税务局根据本地情况确定。

3、对需要立案查处的税务案件，由主管税务机关的主办单位或主办人员提出税务案件立案报告，经主管负责人审批后立案调查。

（二）调查

立案后，办案税务机关应组成调查组，制定调查方案，经领导同意后实施。

1、调查时，应找知情人或被查处对象了解案发的情况及有关线索;根据需要，查阅与被查处对象有关的帐簿、报表、票证等纳税资料，检查其商品、货物和资金往来情况，收集违章证据和有关资料。

2、调查机关和调查人员应将认定的事实同被查处对象见面，认真听取其申辩，然后写出调查报告。调查报告的主要内容应包括：立案依据、违章事实、问题性质、有关人员的责任、被查处对象的基本情况、态度和对其处理意见及其依据，以及调查机关(组)名称、调查人员(签名)和报告时间等。

3、案件查清后，应报经领导批准，转入定性处理。

（三）处理

1、对一切违反税收法规的行为，都应按照《税收征管暂行条例》及其他有关税收法规的规定进行处理。对立案查处的税务案件，都应经过主管税务机关的严格审议。

(1)在做出处理决定或审查结论前，要指定专门机构或专人进行审理。

(2)审理人员应仔细审阅所有案件材料，如发现案情事实不清、证据不足、手续不全等情况，应让调查人员予以增补。

(3)审理结束后，审理人员应签署审理意见或写出审理报告，说明调查人员对案件的事实是否调查清楚，证据是否确凿，定性是否准确，处理意见是否恰当等，连同调查报告和其他有关材料一并报请领导审查决定。

2、对被查处对象主动交待的税务违章问题，可根据其书面交待的违章事实进行处理。如核实后发现交代不实的，还应按照有关规定处理。