1、特别清算方案的制定；清算方案是特别清算的清算组向债权人会议提出并被债权人会议接受的方案。清算方案制定的内容是关于偿还债务的条件比例等事项，当债权不能全额受偿的，应贯彻等差原则和平等原则。

2、特别清算方案的执行，清算方案由清算组执行。清算方案在执行中，难以执行的，由法院宣告破产，进入破产程序。

3、注销登记，清算方案执行完毕，清算组应按规定办理公司注销登记。

一、公司清算的基本流程

一、成立清算组，并办理备案：公司解散清算的，清算组应当自成立之日起10日内将清算组成员、清算组负责人名单向公司登记机关备案。

二、通知、公告债权人：清算组应当自成立之日起10内通知债权人，并于60日内在报纸上公告。通知和公告内容应包括公司名称、住所、法定代表人、注册号、注销原因、清算开始日期、清算组人员及工作地址、申报债权的期限、地点和注意事项等。

三、债权申报和登记：债权人应当自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，向清算组申报其债权。债权人申报债权，应当说明债权的有关事项，并提供证明材料。清算组应当对债权进行登记。在申报债权期间，清算组不得对债权人进行清偿。

四、清理公司财产，编制资产负债表和财产清单，制定清算方案，报股东会或法院确认。

五、执行清算方案，分配财产。

六、编制清算报告，并报告确认。

七、注销登记：

1、申请注销登记。

2、申请注销登记应提交文件。

二、清算公司后如何分配剩余资产吗

按照我国《破产法》的有关规定，剩余财产的分配应分为两个步骤进行。

1、确定分配方案

剩余财产的分配方案，应由清算组提出，经债权人会议讨论通过。《破产法》规定，债权人会议的职权有：

（1）拥有审查有关债权的证明材料，确认债权有无财产担保及其数据；

（2）讨论和通过和解协议草案；

（3）讨论和通过破产财产的处理和分配方案。

人民法院或债权人会议主席均有权在必要时召集债权人会议。债权人会议的决议一经通过，便对全体债权人发生效力，全体债权人必须执行。剩余财产的分配方案经债权人会议讨论通过后，还应报请人民法院裁定后执行。

2、执行分配方案

剩余财产分配方案确定后，应由清算组立即开始执行。破产财产分配完毕，应由清算组提请人民法院终结破产程序。破产程序终结后，未得到清偿的债权不再清偿。在实际工作中，对于不同类型的企业，剩余财产的分配方案应有所不同。对于有限责任公司，一般是按合同、章程的规定或出资者出资比例进行分配。如果公司章程、合同中已专门说明了有关财产的分配办法，则应按规定进行分配；如果没有在合同、章程、协议中作出明确规定，董事会也没有就此作出任何决定的，则应按合资法的规定，按投资各方的股权资本比例进行分配。