犯本罪的，对首要分子，处五年以上十年以下有期徒刑；其他积极参加的，处五年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利。

本罪只追究聚众冲击军事禁区的首要分子和积极参加者的刑事责任，而不追究一般参与者。首要分子，是指在聚众冲击军事禁区犯罪活动中，起组织、策划、指挥作用的犯罪分子：积极参加的，是指主动参加冲击军事禁区犯罪活动的，在实施犯罪申起了重要作用或者有其他犯罪行为的等。

对聚众冲击军事禁区的首要分子，在判处主刑的同时，一般也应附加剥夺政治权利。

一、聚众冲击军事禁区罪的构成要件

犯罪主观方面

本罪的主观方面是故意。即行为人明知是军事禁区而冲击或者明知聚众冲击军事禁区会造成危害后果，却希望或者放任这种结果发生。过失不构成本罪。这种犯罪，行为人往往基于某种个人目的来故意实施，如泄私愤、为达到某种要求而通过聚众扰乱秩序来施加压力等等。

犯罪客观方面

本罪在客观方面表现为聚众冲击军事禁区，严重扰乱军事禁区秩序的行为。我国《军事设施保护法》第15条规定：禁止陆地、水域军事禁区管理单位以外的人员、车辆、船舶进入禁区，禁止对禁区进行摄影、摄像、录音、勘察、测量、描绘和记述，经军区级以上军事机关批准的除外。第33条规定扰乱军事禁区的管理秩序，情节严重的，对首要分子和直接责任人员比照刑法第158条（注：1979年刑法）的规定追究刑事责任；情节轻微，尚不够刑事处罚的，比照治安管理处罚条例第19条的规定处罚。等等。这些都是军事禁区正常秩序的合法保障。聚众冲击军事禁区中的聚众是指纠集多人，强行闯入军事禁区，或占据办公地点，或毁坏财物，或殴打人员。冲击是指使用交通工具或徒步强行闯人军事禁区。严重扰乱军事禁区秩序是指冲击行为使军事指挥机关无法指挥；军事单位的人员、车辆、船只、舰艇无法通过，飞行无法起降；作战、训练、戒严、抢险救灾、战备、科研、教学等正常工作无法进行等。只有严重扰乱军事禁区秩序的行为才构成犯罪，严重扰乱一般是指使军事禁区的公共财物追受严重损失的；军事活动和科研受到妨害而无法进行的；军事禁区受到破坏，导致严重经济损失，等等。聚众冲击军事禁区罪中，阻碍军人依法执行职务的，这种行为属于牵连犯，应按照处理牵连犯的原则，从一重罪处罚，不实行数罪并罚。