合同备案是指加工贸易企业持合法的加工贸易合同到主管海关备案、申请保税并领取加工贸易《登记手册》或其他准予合同备案凭证的行为。备案内容

（1）备案单证商务部主管部门按照权限签发的“加工贸易业务批准证”和“加工贸易企业经营状况和生产能力证明”加工贸易合同或合同副本加工贸易合同备案申请表及企业加工贸易合同备案呈报表属于加工贸易国家管制商品的需交验主管部门的许可证件或许可证件复印件为确定单耗和损耗率所需的有关资料其他备案所需要的单证

（2）备案商品加工贸易禁止类商品不准备案备案时需要提供进出口许可证或两用物项进出口许可证的商品（消耗臭氧层物质、易制毒化学品、监控化学品）备案时需要提供其他许可证件或批准文件的商品（如：进出口音像制品、进口工业再生废料等）

（3）保税额度在加工贸易合同项下海关准予备案的料件，包括为履行产品出口合同进口直接用于加工出口产品而在生产过程中消耗掉的数量合理的触媒剂、催化剂、磨料、燃料全额保税。海关不予备案的料件，及试车材料、非列名消耗性物料等不予保税，进口时按照一般进口货物照章征税。

（4）台账制度按加工贸易银行保证金台帐分类管理的原则，不转、空转、半实转、实转加工贸易手册变更

一、业务流程

（一）企业持进出口合同向外经贸部门申请变更《加工贸易业务批准证》；

（二）企业填写《合同变更申请表》（加盖经营单位公章），到预录入公司数据预录，并打印《企业加工合同变更预申报情况表》；

（三）企业将原备案手册等齐全、有效的单证交海关申请手册变更；

（四）海关办理手册变更审核；

（五）海关开出《银行保证金台帐变更联系单》；

（六）企业向银行申请变更保证金台帐；

（七）海关核注银行开出的《银行保证金台帐变更通知单》；

（八）海关向企业核发《登记手册》。

二、需要提交的单证

（一）原备案加工贸易《登记手册》；

（二）外经贸部门签发的《加工贸易业务批准证》变更证明及相应《备案清单》；（三）《合同备案变更作业呈批表》及相应《变更预录入呈报表》、《加工合同变更预申报情况表》；

（四）加盖外经贸部门审批章的进出口变更合同；

（五）变更申请（加盖公司公章）；

（六）海关按规定需收取的其他单证资料。

（七）报关员证（如属代理的，还须提供委托书）备注：对贸易性质不变、商品品种不变、合同变更金额小于1万美元（含1万美元）的合同，海关不需审核外经贸部门的批准证件。

三、海关工作时限单证齐全有效的，海关自受理企业变更申请之日起5个工作日内审批完毕。