工伤赔偿协议本身就是合同关系，起诉并不当然的决定着协议的合同性质，起诉后仍然是合同关系。变更合同性质的情形：当事人双方经协商同意，并且不因此损害国家利益和社会公共利益；由合同性质和内容决定当事人一方可变更合同；由于不可抗力致使合同的全部义务不能履行；其他。

一、合同变更的情形有哪些

合同变更的情形如下：

1、由合同性质和内容决定当事人一方可变更合同：有的合同是为当事人一方的利益而设立的；也有一些合同的某些条款是专为当事人一方利益约定的。

2、当事人双方经协商同意，并且不因此损害国家利益和社会公共利益：当事人双方在进行协商时，意思表示必须是明确的，而不能是模糊的，否则，当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更。

3、由于不可抗力致使合同的全部义务不能履行：不可抗力是指不能预见或者不能避免、不能克服的客观情况；发生不可抗力，造成合同不能履行或者不能完全履行时，允许当事人变更合同，使合同的履行成为可能；不可抗力必须达到使合同无法履行的程度，才能作为变更合同的理由。

二、能引起合同变更的事由有哪些

以下情形可以导致合同变更：

1、因不可抗力使合同不能履行而变更。

因不可抗力致使合同约定的部分义务不能履行的，当事人可以变更合同。至于不可抗力造成全部义务不能履行，则应当解除合同，而不是变更合同。

2、因情势变化致使合同履行显失公平而变更。

3、因当事人违约而变更合同。

因当事人违约而变更合同的，实际上是赋予了无过错的一方当事人以变更合同的请求权。这里所说的违约，是指当事人不按合同约定履行合同义务。

4、因订立时意思表示不真实而变更。

根据《民法典》规定，下列意思表示不真实的合同可以变更：（1）因重大误解而订立的合同。（2）显失公平的合同。（3）一方以欺诈手段订立的合同。（4）一方以胁迫手段订立的合同。（5）一方乘人之危订立的合同。

5、因当事人自愿而变更合同。

这里所说的当事人自愿，是指在上述四种原因之外，当事人在不违反法律规定、不损害国家利益或者社会公共利益的情况下，双方由于其他原因按照意思自治原则变更合同。