基本医疗保险基金在投资运营中应遵循的原则：一是安全性原则。基本医疗保险基金是消费性基金，最终是要支付给个人的，投资的第一要求必须具有安全性。投资的基金不能回收上来，就不能实现保值的目标。所以，基金结余运用首先要遵循安全性原则。二是收益性原则。基金投资必须要获得一定的收益，这是基金保值增值的基本要求，因此，基金结余的必须遵循收益性原则。三是流动性原则。基金作为一项具有专项用途的基金，主要用于支付与医疗保险待遇有关的费用，因此必须保证支付及时。

一、如何健全基本医疗保险基金监督机构

首先，社会保险经办机构要建立健全基金预决算制度、财务会计制度、审计制度和各项内部管理制度，加强内部管理监督。其次，还要加强对基本医疗保险基金的行政监督、审计监督和社会监督。劳动保障部门和财政部门要对职工基本医疗保险基金预算、决算等进行审核，对基金的收支管理情况进行监督等；审计部门要定期对社会医疗保险的基金收支情况和社会保险经办机构的管理情况进行监督；社会保险基金监督组织、人民代表大会等应定期不定期对职工基本医疗保险基金的收缴、使用等情况进行监督。

二、如何管理基本医疗保险基金

基本医疗保险基金要纳入财政专户，实行收支两条线管理。职工基本医疗保险是政府为保障职工基本医疗而实行的一项社会保险制度，职工基本医疗保险基金是以政府信誉强制征收的、用于职工基本医疗保险的专项基金，是专为基本医疗保险而收、专为基本医疗费用而支的收支相对应、有特定用途的资金，国家必须有较为完善的基金管理和监督体制。职工基本医疗保险基金纳入的财政专户，实行收支两条线管理，能够建立有效的部门间相互制约机制，有利于保证基金的安全。纳入财政专户管理，职工基本医疗保险基金的筹集、支付、运营等各个环节，都处在劳动保障部门、财政部门和金融部门的监控之下，形成三者之间相互协作、相互约束的局面，有利于建立起完善有效的相互制约机制。职工基本医疗保险基金纳入财政专户管理，也与基本养老保险、失业保险等基金管理的办法一致，有利于各项社会保险基金的统一管理。