房地产开发企业的土地使用税在税款的计算方面并没有什么特别的规定。其计算公式仍然为：应纳税额＝计税土地面积×适用税率。对此，《中华人民共和国城镇土地使用税暂行条例》第三条作了明确规定：“土地使用税以纳税人实际占用的土地面积为计税依据，依照规定税额计算征收。”

如果硬要说有什么不同，那么就是有关税收优惠政策上的区别，即房地产开发企业用于建造商品房的土地曾经有过一定的税收优惠。国家税务局《关于印发〈关于土地使用税若干具体问题的补充规定〉的通知》（国税〔89〕地字第140号）曾明确规定：房地产开发公司建造商品房的用地，原则上应按规定征收土地使用税。但鉴于其在商品房出售之前纳税确有困难的具体情况，对房地产开发公司征地后商品房在建期间占用的土地（有偿转让使用的除外），暂缓征收土地使用税。对建成后的商品房占地及院落，从办理验收手续之次月起征收土地使用税。在办理验收手续前已使用或出租出借的商品房占地及院落，应按规定征收土地使用税。在商品房出售后，按土地使用权转移的归属情况划分征免。

不过，按照国家税务总局《关于取消部分地方税行政审批项目的通知》（国税函〔2007〕629号）已经明确规定取消房地产开发企业的这一优惠，因而，自2007年6月11日起，也就是上述文件发布之日起，房地产开发公司征地后商品房在建期间占用的土地也必须按照规定计算缴纳土地使用税。

一、土地使用税减免优惠有哪些

（一）按照《土地使用税暂行条例》和（88）国税地字第015号等文件的规定，经批准开山填海整治的土地和改造的废弃用地，从使用的月份起免税5年至10年。开山填海整治的土地和改造的废弃用地以土地管理机关出具的证明文件为依据确定；具体免税期限由各省、自治区、直辖市税务局在规定的期限内自行确定。

（二）企业办的学校、医院、托儿所、幼儿园，其用地能与企业其他用地明确区分的，可以比照由国家财政部门拨付事业经费的事业单位自用的土地，免征土地使用税。

（三）按照规定，对于企业征用耕地，凡是已经缴纳了耕地占用税的，从批准征用之日起满一年后开始征收城镇土地使用税，在此以前不征收城镇土地使用税，但是征用非耕地因不需要缴纳耕地占用税的应从批准之次月起征收城镇土地使用税。