有影响。总公司对分公司有连带责任，不管债权债务，还是工商税务。分公司不去注销税务，不能如期申报，分公司就会上税务的黑名单，分公司对税务的罚款、处罚不处理，就会连带总公司上黑名单，导致总公司开票、报税都会出现问题。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。

公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法独立承担民事责任。

一、分公司设立流程是什么

（一）申请人持相关材料向市政务服务中心工商局窗口提出申请，经受理审查员初审通过，开具受理通知书或者申请材料接收单；不符合受理条件的，在当场或者5个工作日内一次性告知申请人应当补正的全部材料（出具告知单）。

（二）对申请人申请材料齐全、符合法定形式的，当场作出是否准予登记的决定并出具登记决定通知书；需要对申请材料的实质内容进行核实的，出具企业登记材料需要核实事项告知书，在10个工作日内作出核准或者驳回申请的决定。

（三）在5个工作日后（申请材料的实质内容需核实的除外），申请人可以凭登记决定通知书到发照窗口领取营业执照。

二、分公司与子公司的区别

子公司与分公司都是现代大公司企业经营组织的重要形式，二者都具有经营资格，都具有自己的办公场所。但是，二者有着本质的区别。

二者的法律地位不同

子公司具有独立的主体资格，享有独立的法人地位。分公司则不具有独立的民事和商事主体资格，不具有法人资格。子公司是独立的法人，拥有自己独立的名称、章程和组织机构，对外以自己的名义进行活动，在经营过程中发生的债权债务由自己独立承担。分公司则不具备企业法人资格，没有独立的名称，其名称应冠以总公司的名称，由总公司依法设立，只是公司的一个分支机构。因此，子公司作为独立的法人，在法律上其意志是独立的，母公司对子公司的经营管理活动不能进行直接的命令指挥。分公司作为本公司的分支机构，其业务的执行、资金的调动完全受制于本公司。

二者的名称称谓不同

分公司不具有独立的名称，子公司有自己独立的名称。分公司名称需要加母公司的名称；子公司可以自行起名称，不需要加母公司的名称。分公司其名称中虽有公司字样，但不是真正意义上的公司。而子公司与一般的公司无异，母公司持有分公司的股份，更多的联系还是存在于利益方面。

二者的经营范围不同

分公司经营范围不得超出母公司的经营范围，子公司可以自行选择经营范围，一般无限制。

二者设立的程序不同

分公司的设立程序与一般意义上的公司设立程序不同，设立分公司只需办理简单的登记和开业手续。而子公司需要按照正常规定进行申请和设立。子公司由公司股东按照公司法的规定设立，应当符合公司法对公司设立条件和投资方式的要求。分公司由总公司在其住所地之外向当地工商机关申请设立，属于设立公司分支机构。

二者的财产关系不同

在财产关系结构上，子公司虽然有母公司的参与，但仍有属于自己的财产。分公司的财产则全属于本公司，是本公司财产不可分割的组成部分。分公司没有自己的独立财产，其实际占有、使用的财产是总公司财产的一部分，列入总公司的资产负债表。而子公司的财产是独立的，与总公司财产无关。另外，分公司与总公司之间的资本转移，因不涉及所有权变动，不必负担税收。