一、非法经营烟草6万，检察院一定会公诉吗

未能确定是否必然如此，尽管涉及到六万元的非法经营烟草行为在量刑标准上已经算是较重档次，然而检察机关最终采取何种起诉方式，仍需依据相关问题的复杂程度进行全面衡量。

若该案件的案情事实清晰明确，证据亦坚实可靠，同时满足诉讼条件的话，检察院有望提起公诉；反之，倘若证据存在缺失或者其他无法归纳为诉讼理由的情况，检察院也有可能做出不起诉裁决。

《中华人民共和国刑事诉讼法》

第一百七十五条

人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料；认为可能存在本法第五十六条规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明。

人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。

对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。

对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。

第一百七十六条

人民检察院认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，应当作出起诉决定，按照审判管辖的规定，向人民法院提起公诉，并将案卷材料、证据移送人民法院。

犯罪嫌疑人认罪认罚的，人民检察院应当就主刑、附加刑、是否适用缓刑等提出量刑建议，并随案移送认罪认罚具结书等材料。

第一百七十七条

犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。

对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。

人民检察院决定不起诉的案件，应当同时对侦查中查封、扣押、冻结的财物解除查封、扣押、冻结。对被不起诉人需要给予行政处罚、处分或者需要没收其违法所得的，人民检察院应当提出检察意见，移送有关主管机关处理。有关主管机关应当将处理结果及时通知人民检察院。

二、非法经营烟草60万能缓刑吗

关于非法经营烟草总收入达六十万元该否适用缓刑问题，需依据相关法律法规来进行判断。

若某犯罪分子因实施违法行为而被法院依法判决拘役，或处以三年以下有期徒刑，并且其符合法定缓刑条件，则可考虑予以缓刑的宣告。

值得注意的是，对于年龄未满十八岁者、正在怀孕的孕妇以及年满七十五周岁以上的人士，应对他们实行缓刑。

《中华人民共和国刑事诉讼法》（2018修正）：第五章　证据　　第六十条　对于经过法庭审理，确认或者不能排除存在本法第五十六条规定的以非法方法收集证据情形的，对有关证据应当予以排除。