发生医疗纠纷，首先可以医患双方进行协商调解，调解不成的，医患任何一方均可向主管卫生行政部门提出处理请求。卫生行政部门受理后会指派专人妥善保管原始资料，封存有关医疗物品，组织工作人员展开调查，并形成文字材料。调查研究后，卫生部门会给出处理意见，一般会再次协商调解。

协商不成的，则建议患者或家属诉诸三级医疗事故鉴定委员会，进行鉴定。如对三级鉴定结论不服，可申请复议或二级鉴定。如仍不服，则申请复议和一级鉴定。

卫生行政管理部门和医疗单位根据鉴定结论和有关法规及制度作出相应处理。如对处理结果仍不服的，可以向当地基层人民法院提起诉讼。当然，双方自行协商、请求卫生行政部门处理都不是必经程序，也可直接向法院提起诉讼。

一、医疗纠纷处理程序的调解方式

首先发生医疗纠纷双方先进行调解，调解的方式有三种，可以选择其中一种方式或者一种调解不成功再用其他方式进行调解。调解方式如下：

1、医患沟通：医疗机构及医务人员有尊重患方知情权的义务，应当就患者病情及诊断治疗经过做出专业性的说明解释，加强与患方的沟通，消除误会、化解矛盾。

2、调解：医患双方通过沟通，遵循合法、合理、自愿的原则，互谅互让达成一致和解意见的，应当签订协议书，由医、患双方签字盖章。

3、第三方调解。医疗纠纷可以卫生行政部门第三方来进行行政调解。第三方处于居中地位，通过规范教育，说服引导当事人在平等自愿的基础上达成调解协议。

二、医疗纠纷诉讼的时效有多久

向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。

由此可见，医疗损害责任纠纷的诉讼时效为三年，从知道或者应当知道权利被侵害时起计算。鉴于医疗纠纷专业性极强，实践中一般采用知道而非应当知道的标准，具体来说，即患者知道有损害后果发生时，可以以此作为三年诉讼时效的起算点；或损害后果出现后一段时间，患者通过某种途径知道权利被侵害(即知医院有过错)时，也可以作为一年诉讼时效的起算点。但最终损害后果出现后超过20年患方未起诉的，丧失胜诉权。

同时，如果患者有证据证明其在三年内曾向医院提出赔偿要求，或双方经第三方调节机构调解的，构成诉讼时效中断，诉讼时效期间将从中断之日起重新计算。