网店商标侵权赔偿标准是按照受到侵权的人员因此而受到的损失来进行赔偿。侵犯商标专用权的赔偿数额，按照权利人因被侵权所受到的实际损失确定；实际损失难以确定的，可以按照侵权人因侵权所获得的利益确定；权利人的损失或者侵权人获得的利益难以确定的，参照该商标许可使用费的倍数合理确定。对恶意侵犯商标专用权，情节严重的，可以在按照上述方法确定数额的一倍以上三倍以下确定赔偿数额。赔偿数额应当包括权利人为制止侵权行为所支付的合理开支。

人民法院为确定赔偿数额，在权利人已经尽力举证，而与侵权行为相关的账簿、资料主要由侵权人掌握的情况下，可以责令侵权人提供与侵权行为相关的账簿、资料；侵权人不提供或者提供虚假的账簿、资料的，人民法院可以参考权利人的主张和提供的证据判定赔偿数额。权利人因被侵权所受到的实际损失、侵权人因侵权所获得的利益、注册商标许可使用费难以确定的，由人民法院根据侵权行为的情节判决给予三百万元以下的赔偿。

侵犯商标专用权的赔偿数额，为侵权人在侵权期间因侵权所获得的利益，或者被侵权人在被侵权期间因被侵权所受到的损失，包括被侵权人为制止侵权行为所支付的合理开支。前款所称侵权人因侵权所得利益，或者被侵权人因被侵权所受损失难以确定的，由人民法院根据侵权行为的情节判决给予五十万元以下的赔偿。该规定对商标侵权赔偿的数额看似比较完善，但在实际操作中却存在问题，最具体的无外侵权获得的利益是哪些，被侵权人受到的损失又是哪些，具体数额如何确定。

一、侵权获利计算问题是怎么样的？

对侵权人因侵权所获得的利益计算问题，可以根据侵权商品的销售量与该商品单位利润计算；该商品单位利润无法查明的，按照注册商标商品的单位利润计算。”国家工商行政管理局在1999年12月29日的《关于商标行政执法中若干问题的意见》中也规定：“侵权人在侵权期间因侵权所获得的利润一般是指销售收入减去成本及应缴纳的税金。销售收入的计算只涉及侵权人的实际收入，即已销出商品部分的收入不包括库存商品。”

以上两种计算方法虽然不同，但其基准都是侵权获得利润。然而在商业运行中，企业获得的利润可以分为主营业务利润、利润总额和净利润三种。主营业利润是指销售获得的所有收入，扣除成本后的部分；利润总额是指税前收入，所得税应当退库作为销售赔偿额的一部分，其他支出应予扣除，产品销售税则不退税；净利润是指利润不仅应当扣除成本，还应当扣除其他支出，以侵权人在侵权期间获得的纯利润作为赔偿额。在侵权获得利润的赔偿问题上，选择主营业利润作为侵权赔偿的金额是较为合理的，既无需交纳非因自己经营产生的所得税以保护被侵权人的利益，还有利于阻吓侵权行为。

但是，对于商标侵权中有的商标侵权的对象只是商标权人产品中的一项或几项产品，而非所有产品的情况，就应当采取不同的计算方法。在实践中比较实用的计算公式是：侵权获利=侵权期间总销售额×侵权商品配比率×利润率。其中，侵权商品配比率是指侵权商品在所有商品中所占的比例，而根据以上对侵权获得利润的论述，侵权期间总销售额与侵权商品配比率的积就是上文中的主营业利润。