合作医疗和医保可以同时交。

社保和农村合作医疗区别如下：

1、定义不同

社保是用人单位给予劳动者的养老、医疗、失业、工伤、生育保险待遇的合称，农村合作医疗全称新型农村合作医疗保险，现在已经跟跟城镇居民医保合并为城乡居民基本医疗保险，也叫做新农合，是以大病统筹为主，个人、集体、政府多方筹资，农民自愿参加的医疗互助共济制度。

2、规定不同

职工社保是强制性的，在职期间，公司和个人都要按照国家的规定进行缴费。而农村合作医疗是自愿缴费，是农民自愿参加的。此外还有参保人群户籍规定，农村合作医疗只有农村户口才可以参保，而职工社保是没有户籍要求的。

3、缴费方式

职工社保是每个月都需要缴纳的，而农村合作医疗是每年缴费一次，今年缴纳的是明年的保障费用。

4、缴费标准

职工社保缴纳费用由单位和个人共同承担。其支付金额跟个人的工资水平有关，工资越高的，社保交的钱就越多。而农村合作医疗费用一般由个人承担，国家会补贴一部分，总体金额要少很多。

5、参保年限

社保医疗保险按年限男女有别，男性参保年限为25年，女性为20年，就能一直享受医疗保障。医保支付中断会影响医保待遇，医保中断缴费从下个月起不再享受医疗保险。而农村合作医疗是每年一交，只要交了就可以享受一年的报销待遇，不交就不能享受。

6、使用范围

社保医保缴费可用于挂号、就医、药房购药、住院报销等；农村合作医疗目前只能报销住院费用，少数城市看病也可以报销。

7、报销比例

职工医保的报销范围从药店买药、医院门诊、就医住院全部包括，而现在报销范围一般在70％以上，有部分城市甚至能达到80％－85％。农村合作医疗报销范围要比职工医保窄一些，只有门诊、住院和大病报销这三种，报销比例只有50％到80％左右。

8、起付线不同

职工社保报销起付线比农村合作医疗略高一些，分为在职员工和已退休人员，起付下限分别为1800元和1300元，报销比例分别为75％和85％。农村合作医疗起付线是按医院级别划分，一级医院起付线为100元，二级为550元，报销比例分别为55％和50％。

法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二十五条

国家建立和完善城镇居民基本医疗保险制度。

城镇居民基本医疗保险实行个人缴费和政府补贴相结合。

享受最低生活保障的人、丧失劳动能力的残疾人、低收入家庭六十周岁以上的老年人和未成年人等所需个人缴费部分，由政府给予补贴。

第二十六条

职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。

第二十七条

参加职工基本医疗保险的个人，达到法定退休年龄时累计缴费达到国家规定年限的，退休后不再缴纳基本医疗保险费，按照国家规定享受基本医疗保险待遇；未达到国家规定年限的，可以缴费至国家规定年限。

第二十八条

符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。

合作医疗怎么才能交

1．缴费时间到了，村上干部会组织统一收费，有些直接上门收费，把保费直接交给村干部即可；2．网上缴费可直接登录当地社保局官网，找到”新农合缴费“入口，在线完成支付即可；3．个别地区有专门的社保APP，注册登录并完成实名认证等可线上缴费。