1、折价补偿

《民法典》规定：合同无效或者被撤销后，因该合同取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。由于建设工程施工合同的特殊性，合同被认定无效或被撤销后，承包人已将其劳动和建筑材料物花到了建筑工程上，工程施工合同无效后，返还财产已无法实现，所以对承包人的投入只能以折价补偿的方式处理。

根据规定，建设工程施工合同被确认无效后，如建设工程竣工验收合格或经修复后合格的，承包人请求参照合同约定支付工程款，法院应予支持。合同无效，经修复后验收不合格的，承包人请求支付工程价款的，不予支持。

2、过错赔偿

依据《民法典》规定，合同无效或者被撤销后，有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。

《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第三条规定，施工合同无效，因建设工程不合格造成损失，发包人有过错的，也应承担相应的民事责任。

3、收缴非法所得

《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第四条规定：承包人非法转包、违法分包建设工程或者没有资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义与他人签订建设工程施工合同的行为无效。人民法院可以根据民法典规定，收缴当事人已经取得的非法所得。

一、建设工程合同无效的法律后果

司法解释和司法意见均有散见的规定。具体有以下情形：

1、建设工程经竣工验收合格的建设工程施工合同无效，但建设工程经竣工验收合格，承包人请求参照合同约定支付工程价款的，应予支持。

2、建设工程经竣工验收不合格的建设工程施工合同无效，且建设工程经竣工验收不合格的，按照以下情形分别处理：

（一）修复后的建设工程经竣工验收合格，发包人请求承包人承担修复费用的，应予支持；

（二）修复后的建设工程经竣工验收不合格，承包人请求支付工程价款，不予支持。因建设工程不合格造成的损失，发包人有过错的，应承担相应的民事责任。

3、承包人超越资质等级许可的业务范围签订建设工程施工合同，在建设工程竣工前取得相应资质等级，当事人请求按照无效合同处理的，不予支持。

4、人民法院可收缴当事人已经取得的非法所得。

5、合同无效，但工程经竣工验收合格或交付使用，但合同价款约定不明的，应当按工程定额、工程量对工程造价进行鉴定，以鉴定结果确定工程价款。

6、合同无效，工程竣工验收合格，发包人要求扣除工程折价款中所含利润的，人民法院不予支持。

7、合同无效，发包人与承包人达成的结算协议有效。

二、关于建设工程施工合同无效的情形

依据相关法律法规规定，以下六种情形可导致此类合同无效：

1、承包人未取得建筑施工企业资质或者超越资质等级而签订的工程施工合同无；

2、没有资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义签订的工程施工合同无效；

3、建设工程必须进行招标而未招标或者依据无效中标而签订的工程施工合同无效；

4、承包人非法转包建设工程签订的工程施工合同无效；

5、承包人违法分包建设工程签订的工程施工合同无效；

6、未取得建设用地使用权证、建设工程规划许可证、未办理报建手续的三无工程的发包人与承包人签订的工程施工合同无效。