三类医疗器械经营许可证的办理方式：首先，经营者向所在地设区的市级人民政府负责药品监督管理的部门申请经营许可。然后，负责药品监督管理的部门应当对申请资料进行审查。对符合规定条件的，准予许可并发给医疗器械经营许可证。

一、营业执照由什么部门办理

营业执照由主管部门办理。一些行业需要办理的营业执照包括烟草专卖许可证、药品营业执照、危险化学品营业执照、广告营业执照、快递营业执照等。其中，食品经营许可证由申请人向县级以上地方食品药品监督管理部门提交；广告经营许可证由申请人向县级以上广告监督管理机关提交。申请不同行业的营业执照所需的材料不同，通常所需的材料有：

1、申请营业执照；

2、营业执照复印件；

3、经营场所使用证明；

4、营业执照行业所需的其他文件。

二、卖医疗器械需要办什么证

卖医疗器械需要办理《医疗器械经营许可证》。

医疗器械经营许可证为医疗器械经营企业必须具备的证件，开办第二类医疗器械经营企业，应当向省、自治区、直辖市人民政府药品监督管理部门备案；开办第三类医疗器械经营企业，应当经省、自治区、直辖市人民政府药品监督管理部门审查批准，并发给《医疗器械经营企业许可证》。

医疗器械经营许可证现为后置审批，工商行政管理部门发给营业执照后申请审批。《医疗器械经营企业许可证》有效期为5年。审查核准《医疗器械经营企业许可证》（第二、三类医疗器械）变更企业名称、法定代表人、企业负责人、质量管理人、注册地址、仓库地址、经营范围。

医疗器械经营许可证的相关要求：

1、具有与经营规模和经营范围相适应的质量管理机构或者专职质量管理人员。质量管理人员应当具有国家认可的相关专业学历或者职称；

2、应当建立健全产品质量管理制度，包括采购、进货验收、仓储保管、出库复核、质量跟踪制度和不良事件的报告制度等；

3、省、自治区、直辖市（食品）药品监督管理部门应当依据本办法，结合本辖区实际，制定医疗器械经营企业检查验收标准，报国家食品药品监督管理局备案。

三、开药店需要什么条件及手续

1、具有依法通过资格认定的药学技术人员。

2、具有与所经营药品相适应的营业场所、设备、仓储设施、卫生环境。

3、具有与所经营药品相适应的质量管理机构及其管理者。

4、具有保证所经营药品质量的规章制度.申请开办药店时,应该向所在地的市级药品监督管理机构或省、自治区、直辖市人民政府药品监督管理部门直接设置的县级药品监督管理机构提出申请.申领到《药品经营许可证》后,再到工商行政管理部门办理登记注册。