如果确实公司存在债务的，人民法院会判决公司偿还债务，如果公司不偿还的，当事人可以申请强制执行。如果防止公司债务纠纷：

一、防患于未然是维护企业自身权益的前提防患于未然，是维护企业自身权益的前提基础，因为债务纠纷在许多情况下是可以避免的。现代交易，实际上就是合同交易，是口头或书面合同的具体履行．但是合同在订立履行时会遇到很多风险。所以在合同订立时不要使用含糊不确定的词语，要知道，合同中的每一个条款，每一句话，每一个字，甚至每一个标点符号都是十分重要的．千万不要忽视合同细节。为了预防日后债务纠纷的发生，最好的办法就是让对方在签订合同时进行担保。

二、积极催要货款避免企业陷入债务纠纷中国人向来讲人情，重友谊，看发展，认为催款太紧会使对方不愉快，影响以后的交易，一般不到最后日期，不愿意行使自己作为债权人的权利。其实，这是一种错误观念。如果总是担心对方不高兴，那么永远都会收不到货款，而且未必保证以后的交易能顺利进行。客户所欠货款越多，支付越困难，越容易转向第三方购买，我们就越不能稳住这一客户，所以还是加紧催收才是上策，否则超出了诉讼时效就会无法挽回损失。只有钱货两清，才能继续洽谈新的生意。催收货款若不理直气壮，就会被对方牵着鼻子走，本来能够收回的货款也有可能收不回来。所以，催要货款时最好直截了当的表明自己的来意，不要让对方认为延期还款是理所应当的。

三、灵活运用法律规则是企业维护自身权益的最后保障在遇到公司债务纠纷的时候，要考虑用法律手段来维护自己的权益了。诉讼是最有效的维权手段。企业用诉讼手段来维权时，一定要及时准确。通过诉讼途径解决债务纠纷虽然具有效力强、权威高的优点，但确也存在成本高、时间长等问题。如果灵活选取和运用其它的法律规则，可一定程度避免上述问题，从而控制成本、提高效率、降低风险，具体来讲有以下几种办法：

（1）灵活约定仲裁在合同签定时，如果面临标的大、对方履约诚信差、以及地方保护主义严重等情形时，一般可以采用仲裁的方式，仲裁具有的专业性、灵活性、保密性、快捷性、经济性、独立性的特点以及一裁终局的规定，就可以使我们减少成本，缩短时间，提高效率，减少诉讼带来的麻烦。

（2）适当采纳公证在合同签定的时侯，也可以通过当地公证处进行公证，公证书具有比其他单位和个人提供的证明文件更高的证据能力，司法机关和仲裁机关一般无须审查就可以直接作为认定事实的根据。对于经过公证的合同，在一方违约时，由于公证具有强制执行的效力，对于不履约的经过公证的合同，可以提交法院申请强制执行。

（3）巧妙选取代理在异地诉讼的时候，由于地方保护主义的干扰，对方当事人具有“主场优势”，因此为了保证诉讼取得良好的效果，在必要的时候选取一定的代理机构，对于债务的解决也具有润滑和加持的作用。

（4）适时申请支付令当双方是金钱债务纠纷，并且在债权债务关系清晰的时候，债权人通过向法院申请支付令，由法院向对方当事人发送支付令，在规定时期不履行时，可通过法院强制执行。缺点是一旦对方提出异议，就要进入普通诉讼程序，所以具有不确定的因素。以上就是为您整理的内容，一个企业在运行的过程中会遇到很多的债务纠纷，在处理的的时候，要合理的利用法律的武器维护自己的权利。