个人所得税专项扣除不是扣工资。专项附加扣除指的是，在计算综合所得应纳税额时，除了5000起征点和“三险一金”等专项扣除外，还允许额外扣除的项目，如子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或住房租金，以及赡养老人等专项附加扣除等六项费用。专项附加扣除于2019年1月1日起施行，折算到月收入的个税计算方式如下：

月度收入－5000元起征点－专项扣除三险一金等－专项附加扣除－依法确定的其他扣除＝应纳税所得额

因此，实发工资＝应发工资－各项扣款（包括责任扣款和法定扣款）。

个人所得税专项附加扣除怎么退税

1、首要条件就是年度你已经纳过税，且应纳税额已经预收预缴的税款金额。

2、下个人所得税APP，注册账号，登陆账号。个人所得税APP非常智能，注册好之后，在个人中心完善个人信息，并添加银行卡，这张银行卡就是税款将要退回的地方。

3、查询年度的纳税明细。可以在首页的“收入纳税明细查询”一栏中查询，里面有年度和每个月的的收入金额和已申报税额。

4、在办税界面－税费申报－综合所得汇算申报处进行申报。默认的是简易申报，系统已经自动计算出退税金额。如果需要调整申报数额，可以切换到“标准申报”进行办理。确认提交后就可以申请退税啦。

5、等待。在服务界面－申报信息查询中，点击申报查询可以查看退税的进度。

需要注意的是，为方便纳税人获取退税，纳税人年度综合所得收入额不超过6万元且已预缴个人所得税的，税务机关在网上税务局（包括手机个人所得税APP）提供便捷退税功能，通过简易申报表办理年度汇算退税。

二、怎么计算需要退税还是需要补税

计算公式如下：

年度汇算应退或应补税额＝［（综合所得收入额－60000元－“三险一金”等专项扣除－子女教育等专项附加扣除－依法确定的其他扣除－捐赠）适用税率－速算扣除数计算结果大于0，税务局会给我们退税，计算结果小于0，我们需要补税给税务局。

综合所得收入额＝1月1日至12月31日取得的工资薪金、劳务报酬、稿酬、特许权使用费等四项所得（以下称“综合所得”）的收入额。

个人不会操作的可以打电话给税务局或者是问公司的财务。这个税务局是让个人进行操作的，也是让个人知道自己具体每个月缴纳多少的税，防止企业偷税漏税。有退税的直接在系统里面提交资料就可以，最一定的时间之内会退税的。

《中华人民共和国个人所得税法》第六条

应纳税所得额的计算：

（一）居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。

（二）非居民个人的工资、薪金所得，以每月收入额减除费用五千元后的余额为应纳税所得额；劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，以每次收入额为应纳税所得额。

（三）经营所得，以每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，为应纳税所得额。

（四）财产租赁所得，每次收入不超过四千元的，减除费用八百元；四千元以上的，减除百分之二十的费用，其余额为应纳税所得额。

（五）财产转让所得，以转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额，为应纳税所得额。

（六）利息、股息、红利所得和偶然所得，以每次收入额为应纳税所得额。

劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得以收入减除百分之二十的费用后的余额为收入额。稿酬所得的收入额减按百分之七十计算。

个人将其所得对教育、扶贫、济困等公益慈善事业进行捐赠，捐赠额未超过纳税人申报的应纳税所得额百分之三十的部分，可以从其应纳税所得额中扣除；国务院规定对公益慈善事业捐赠实行全额税前扣除的，从其规定。

本条第一款第一项规定的专项扣除，包括居民个人按照国家规定的范围和标准缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险等社会保险费和住房公积金等；专项附加扣除，包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等支出，具体范围、标准和实施步骤由国务院确定，并报全国人民代表大会常务委员会备案。