一、公司在云南可以在异地税务机关开普通进项工程款发票吗

不可以。

根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十五条：除国务院税务主管部门规定的特殊情形外，发票限于领购单位和个人在本省、自治区、直辖市内开具。省、自治区、直辖市税务机关可以规定跨市、县开具发票的办法。

根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十九条：开具发票的单位和个人应当按照税务机关的规定存放和保管发票，不得擅自损毁。已经开具的发票存根联和发票登记簿，应当保存5年。保存期满，报经税务机关查验后销毁。

根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十四条：任何单位和个人应当按照发票管理规定使用发票，不得有下列行为：

(一)转借、转让、介绍他人转让发票、发票监制章和发票防伪专用品;

(二)知道或者应当知道是私自印制、伪造、变造、非法取得或者废止的发票而受让、开具、存放、携带、邮寄、运输;

(三)拆本使用发票;

(四)扩大发票使用范围;

(五)以其他凭证代替发票使用。

二、现在异地怎么开税票

改增之前，需要持有机构所在地地方税务局开具的《外出经营活动税收管理证明》到项目所在地地方税务局办理报验登记，在工程所在地自行开具或代开建筑业发票。营改增之后，改为持有机构所在地国家税务局开具的《外出经营活动税收管理证明》到项目所在地办理报验登记，但是建筑企业可以自行开具增值税发票。

根据《国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点有关税收征收管理事项的公告》(国家税务总局公告2016年第23号)规定：提供建筑服务，纳税人自行开具或者税务机关代开，应在发票的备注栏注明建筑服务发生地县(市、区)名称及项目名称。

对于纳税人身份与不同的计税方式如何开具发票可以归纳为：

1.一般纳税人采用一般计税方法的项目开具发票：

纳税人自行开具。以取得的全部价款和价外费用全额开具增值税专用发票或增值税普通发票，备注栏注明建筑服务发生地所在县(市、区)及项目名称。申报时全额计税，允许抵扣所取得的进项税额。

2.一般纳税人采用简易计税方法的项目(符合规定的老项目、甲供材、清包工)开具发票：

纳税人自行开具。以取得的全部价款和价外费用全额开具增值税专用发票或增值税普通发票，备注栏注明建筑服务发生地所在县(市、区)及项目名称。申报的税款按差额计税，不得抵扣所取得的进项税额。

对异地施工增值税发票如何开具，建议咨询主管税务机关后确定。

政策依据：1.财税〔2016〕36号：财政部、国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知

2.国家税务总局公告2016年第23号：国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点有关税收征收管理事项的公告。