纳税人发票保管5年后，经税务机关检查销毁。根据《中华人民共和国发票管理办法》第29条，发票单位和个人应按税务机关规定保管发票，不得擅自损坏。已发行的发票存根联和发票登记簿应保存5年。保存期满，经税务机关检查销毁。

不得开具增值税发票的情形

1、减免税收入不能开增值税专用发票，包括免税和处置自用固定资产享受3％征收率减按2％征收优惠的情况。

2、向消费者个人销售货物、提供加工修理修配劳务、销售服务、无形资产或者不动产。

3、某些特殊科目或行业不能开具增值税专用发票，比如餐饮业、销售金融资产、贷款、客运业等。

4、在部分差额纳税的规定下，扣减的销售额部分不能开增值税专用发票。

5、一般纳税人会计核算不健全时，不能开增值税专用发票。

6、实行增值税退（免）税办法的增值税零税率应税服务不得开具增值税专用发票。

7、不征收增值税项目不得开具增值税专用发票。

8、小规模纳税人销售自己使用过的固定资产，不得向税务机关申请代开增值税专用发票。

9、纳税人销售旧货，不得自行开具或者代开增值税专用发票。

10、商业企业一般纳税人零售烟、酒、食品、服装、鞋帽（不包括劳保专用部分）、化妆品等消费品，不得开具增值税专用发票。

11、一般纳税人的单采血浆站销售非临床用人体血液，可以按照简易办法依照3％征收率计算应纳税额，但不得对外开具增值税专用发票。

12、应当办理一般纳税人资格登记而未办理的，按销售额依照增值税税率计算应纳税额，不得抵扣进项也不得开具增值税专用发票。

13、金融商品转让，不得开具增值税专用发票。

14、经纪代理服务，以取得的全部价款和价外费用，扣除向委托方收取并代为支付的政府性基金或者行政事业性收费后的余额为销售额。向委托方收取的政府性基金或者行政事业性收费，不得开具增值税专用发票。

15、试点纳税人根据2016年4月30日前签订的有形动产融资性售后回租合同，在合同到期前提供的有形动产融资性售后回租服务，选择继续按照有形动产融资租赁服务缴纳增值税的，经人民银行、银监会或者商务部批准从事融资租赁业务的试点纳税人，可以选择以向承租方收取的全部价款和价外费用，扣除向承租方收取的价款本金，以及对外支付的借款利息（包括外汇借款和人民币借款利息）、发行债券利息后的余额为销售额。向承租方收取的有形动产价款本金，不得开具增值税专用发票，可以开具普通发票。

16、试点纳税人提供旅游服务，可以选择以取得的全部价款和价外费用，扣除向旅游服务购买方收取并支付给其他单位或者个人的住宿费、餐饮费、交通费、签证费、门票费和支付给其他接团旅游企业的旅游费用后的余额为销售额。选择上述办法计算销售额的试点纳税人，向旅游服务购买方收取并支付的上述费用，不得开具增值税专用发票，可以开具普通发票。

17、提供劳务派遣服务选择差额纳税的纳税人，向用工单位收取用于支付给劳务派遣员工工资、福利和为其办理社会保险及住房公积金的费用，不得开具增值税专用发票，可以开具普通发票。

18、纳税人提供人力资源外包服务，向委托方收取并代为发放的工资和代理缴纳的社会保险、住房公积金，不得开具增值税专用发票，可以开具普通发票。

19、纳税人在地税机关已申报营业税未开具发票，2016年5月1日后需要补开发票的，不得开具增值税专用发票。

20、一般纳税人销售自行开发的房地产项目，其2016年4月30日前收取并已向主管地税机关申报缴纳营业税的预收款，未开具营业税发票的，可以开具增值税普通发票，不得开具增值税专用发票。

要注意的是，报销要及时，发票时间尽量不要跨年，否则不能税前扣除。

《中华人民共和国发票管理办法》第二十九条