毁灭国家机关印章罪应根据下列规则处罚：

1、犯毁灭国家机关印章罪的，一般处以三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金；

2、属于情节严重情形的，则应处以三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

毁灭国家机关印章罪的犯罪构成

1、客体要件本罪所侵害的客体是国家机关的正常活动。

2、客观要件盗窃国家机关证件罪本罪在客观方面表现为盗窃、抢夺或者毁灭国家机关公文、证件或印章的行为。盗窃的必须是国家机关的公文、证件或印章，才能构成本罪。如果所盗窃的不是公文、证件、印章或者虽是公文、证件、印章但不属于国家机关的公文、证件、印章、亦不能构成本罪。伪造的公文、证件、印章也不能满足本罪的构成要件。构成犯罪的，应当以他罪如盗窃罪、盗窃武装部队公文、证件、印章罪等治罪。所谓抢夺，即公然夺取，是指当着公文、证件、印章所有人、保管者、使用者的面而突然夺取公文、证件、印章的行为。既可以是乘人不备，又可以是在他人有备的情况下公然夺取，如在保管人患病、中轻度醉酒减弱防护能力但神智清醒的情况下公开夺取等。构成犯罪的，应是构成他罪如抢夺罪、抢夺武装部队公文、证件、印章罪等。

3、主体要件本罪的主体为一般主体，即年满l6周岁具有刑事责任能力的自然人，均可构成本罪。既可以是军人，又可以是非军人。

4、主观要件本罪在主观方面必须出于故意，即明知是国家机关的公文、证件及印章而仍决意盗窃、抢夺或毁灭。过失不能构成本罪。如果不知是公文、证件、印章而盗窃、抢夺或毁灭的，不能构成本罪，但可构成他罪如盗窃罪、抢夺罪等。至于其动机可多种多样，或为了招摇撞骗，或为了出卖谋利，或为了自用，等等，不论动机如何，均不影响本罪成立。

《刑法》第二百八十条

伪造、变造、买卖或者盗窃、抢夺、毁灭国家机关的公文、证件、印章的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金；情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

伪造公司、企业、事业单位、人民团体的印章的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金。

伪造、变造、买卖居民身份证、护照、社会保障卡、驾驶证等依法可以用于证明身份的证件的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金；情节严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。