分公司跟总公司之间是非独立核算，那么，分公司的所有税种的申报，都必须由总公司汇总，由总公司申报。非独立核算的分公司仅仅只是总公司的一个分支机构，相当于一个部门。如果分公司是非独立核算，那么就不是独立法人。

一般情况下，如果分公司是个独立核算的群体，既有营业收入，又有支出，分公司虽小，但是五脏俱全，这种情况下的分公司，从财政考核上考虑，相信很多企业领导人都会做出一个决定，总分公司财政独立，个子独立核算。独立核算下的分公司，需要向当地税务机关申报纳税。

报税有专人负责纳税申报工作，每月1日－15日进行代理报税服务，按照财政和税务部门的要求编制和打印月度会计报表，主要包括资产负债表、损益表、主要税金明细表；各种纳税申报表。外勤会计到税务所上门申报。专人负责网上纳税申报。

一、设立分公司的好处

1、分公司一般便于经营，设立比较简单，财务会计制度的要求也比较简单；

2、分公司不是独立法人，就增值税需要在所在地缴纳，所得税由总公司合并纳税。节省很多税收；

3、在分公司经营初期，分公司往往会出现亏损，但其亏损可以冲抵总公司的利润，减轻集团企业的整体税收负担；

4、分公司与总公司之间的资产转移比较灵活，因不涉及所有权变动，不需要签订各种合同，也不需要交各种税费。人员的流动也比较灵活，不需要重新签订一个劳动合同。但是子公司的与母公司的是不同的劳动合同的主体，人员的调动需要重新签订劳动合同；

5、分公司不需要章程设计，不需要三会一层的设计，不需要设计股东会，董事会，监事会，经理层。只需要一个负责人做分公司总经理就可以了。

二、分公司负责人需要承担哪些责任

分公司负责人在法律上一般不对外承担责任，只是相当于总公司一个部门。分公司不具有企业法人资格。分公司的经营范围一般不得超过总公司的经营范围。故法律上，分公司的负责人的权限亦受总公司的章程的约束。

分公司不对总公司承担责任。分公司的财产归属于总公司，没有自己独立的财产，与总公司在经济上是统一核算的，其在经营活动中的负债由总公司负责清偿。其实际占有和使用的财产是总公司财产的一部分，列入总公司的资产负债表中。即使分公司有能力承担部分或全部责任，实际的和最终的责任承担者还是总公司。公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。