1、含义不同：

3％为小规模纳税人增值税税率；17％为一般纳税人增值税税率。

2、享受的税收的政策不一样：

小规模纳税人不能抵扣进项税，只有一般纳税人才能抵扣进项税额。

一般纳税人抵扣进项税的条件：

（1）必须取得增值税专用发票才能抵扣进项税。

（2）取得小规模纳税人在国税代开的增值税专用发票，可以按3％抵扣进项税。

3、发票性质不同：

3％的税率在增值税普通发票使用较多的；17％税率常见于增值税专用发票。税法规定必须取得增值税专用发票才能抵扣进项税，进项增值税发票经过认证可以抵扣税金，普通发票不能抵税。

增值税发票和电子发票的区别

电子普通发票即电子增值税普通发票，和电子增值税专用发票的主要区别在于是否可以用于增值税进项税额的抵扣，同时电子增值税普通发票的发票抬头会显示“增值税电子普通发票”的标识；电子增值税专用发票的发票抬头会显示“增值税电子专用发票”的标识。增值税发票和电子发票的区别如下：

1、形式上的区别：

（1）电子发票就是电子形式的发票；

（2）增值税发票是纸质的发票，分为增值税普通发票和增值税专用发票；

2、抵扣上的区别：

（1）电子发票原来只有电子普通发票，现在也有了电子专用发票；

（2）如果是增值税专用发票，不论是纸质的专票、还是电子专用发票，都可以正常抵扣；

3、取得方式的区别：

（1）电子发票是通过电子发票服务平台查询、下载取得的；

（2）传统纸质发票是由销售方直接开出来，然后购买方拿到第二联或者第三联用于税前抵扣；

4、发票联数的区别：

（1）电子发票只有一联，供收票方、开票方分别下载使用；

（2）纸质版的增值税普通发票有2联和5联两种。

法律依据：《中华人民共和国发票管理办法》第二十三条

安装税控装置的单位和个人，应当按照规定使用税控装置开具发票，并按期向主管税务机关报送开具发票的数据。

使用非税控电子器具开具发票的，应当将非税控电子器具使用的软件程序说明资料报主管税务机关备案，并按照规定保存、报送开具发票的数据。

国家推广使用网络发票管理系统开具发票，具体管理办法由国务院税务主管部门制定。

《中华人民共和国增值税暂行条例》

第二条增值税税率：

（一）纳税人销售或者进口货物，除本条第（二）项、第（三）项规定外，税率为17％。

（二）纳税人销售或者进口下列货物，税率为13％：

1．粮食、食用植物油；

2．自来水、暖气、冷气、热水、煤气、石油液化气、天然气、沼气、居民用煤炭制品；

3．图书、报纸、杂志；

4．饲料、化肥、农药、农机、农膜；

5．国务院规定的其他货物。

（三）纳税人出口货物，税率为零；但是，国务院另有规定的除外。

（四）纳税人提供加工、修理修配劳务（以下称应税劳务），税率为17％。

税率的调整，由国务院决定。

第二十条增值税由税务机关征收，进口货物的增值税由海关代征。

个人携带或者邮寄进境自用物品的增值税，连同关税一并计征。具体办法由国务院关税税则委员会会同有关部门制定。