首先，规定双方的权利和义务。尤其要说明在分居期间，夫妻双方不再有义务与其丈夫或妻子同居。

其次，协议中要说明子女有谁抚养，抚养费如何承担以及探望权如何行使?

(一)可以对分居期间的财产进行约定，如无约定或无法达成协议，则仍视为夫妻共同财产。双方若同意，可以在协议中规定分居期间双方不再互相享有家事代理权(但无法对抗善意第三人)，如果一方违反则要赔偿另一方的损失。双方若同意，可以约定分居期间因为一方而产生的债务一律视为个人债务(同样无法对抗善意第三人)，一方如果违反要赔偿另一方的损失。

(二)分居的期限，应以三个月至两年为限，期限届满，如一方当事人依然认为感情无法复合而要求离婚的，可协议离婚或持该协议向法院起诉离婚。

(三)分居的终止。协议分居可基于当事人双方的协议而终止，但应当制作终止分居的书面协议，或办理终止分居的公证。

实践中，几乎所有公证处都没有将分居协议明确列入民事协议公证的范围，当事人如果在当地公证处拒绝受理的情况下，可选择找当地律师事务所律师见证，或两个邻居，同事见证的方式，或者只要双方同时签字认可即可，而不必公证及见证。

一、夫妻已分居未离婚婚内债务怎么办

分居期间个人所借债务是否属于夫妻共同债务，我们首先要看该债务是否为夫妻共同生活而产生；

其次，第三人是否明知债务夫妻属于分居阶段，如果不是为夫妻共同生活所需，第三人也明知的话，该债务视为夫妻个人债务。

属于个人债务的包括：

(一)夫妻一方的婚前债务，已转化为共同债务的除外；

(二)夫妻一方未经对方同意，擅自资助没有法定扶养义务人所欠的债务；

(三)夫妻一方未经对方同意，独自筹资从事生产或经营活动所负债务且其收入确未用于共同生活的；

(四)遗嘱或赠予合同中确定的只归夫或妻一方的财产，附随该遗嘱或赠予合同而来的债务；

(五)夫妻双方约定由一方负担的债务，但此种约定原则上不具有对抗债权人的效力；

(六)夫妻一方不合理的开支，如赌博、吸毒等所负债务；

(七)其他依法应由个人承担的债务。