一、住院是先扣医保还是垫付

视具体情况而定。

1.患者自付费用时，要告知医院收费窗口的工作人员，自己有医保，但是未携带相关证件。2.如实告知之后，患者就需要支付自己的医疗费用，然后妥善保管好相关的所有票据，严防丢失，以免造成不必要的麻烦或者不能报销的情况发生。待日后携带医保证件的时候进行报销，但是这个日后的时间是有限制的，一般比较短(且因为各地行政区的管理办法略有不同，所以具体时间也可能有所不同，具体时间可以咨询就诊医院或者当地医保部门)，所以需要大家尽快办理。3.报销情况一般分为两种。一种是拿票据再报销，一种是医院直接和社保结算。4.异地保民结算程序：需要在患者治疗结束之后进行程序操作。由所在单位在规定时间之内执行，需要提供参保人员的医保证件、病历、医药费的收据、住院费用详细清单、治疗处方等有效材料。5.患者转诊转院结算程序：需要在患者治疗结束之后进行程序操作。由参保人员本人或者其指定的代理人在规定时间之内执行，需要提供参保人员的转诊转院审批表、病历、医药费的收据、住院费用详细清单、治疗处方等有效材料，处理地点为医保经办机构。法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二十三条职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。第二十四条国家建立和完善新型农村合作医疗制度。新型农村合作医疗的管理办法，由国务院规定。第二十五条国家建立和完善城镇居民基本医疗保险制度。城镇居民基本医疗保险实行个人缴费和政府补贴相结合。享受最低生活保障的人、丧失劳动能力的残疾人、低收入家庭六十周岁以上的老年人和未成年人等所需个人缴费部分，由政府给予补贴。

二、医疗保险的结算流程是怎样的

(一)住院及特殊病种门诊治疗的结算程序

定点医疗机构于每月10日前，将上月出院患者的费用结算单、住院结算单及有关资料报医疗保险经办机构，医疗保险经办机构审核后，作为每月预拨及年终决算的依据。医疗保险经办机构每月预拨上月的住院及特殊病种门诊治疗的统筹费用。

经认定患有特殊疾病的参保人员应到劳动保障部门指定的一家定点医疗机构就医购药，发生的医药费用直接记帐，即时结算。

(二)急诊结算程序

参保人员因急诊抢救到市内非定点的医疗机构及异地医疗机构住院治疗，发生的医疗费用，先由个人或单位垫付，急诊抢救终结后，凭医院急诊病历、检查、化验报告单、发票、详细的医疗收费清单等到医疗保险经办机构按规定办理报销手续。

(三)异地安置人员结算程序

1、异地安置异地工作人员由其所在单位为其指定1-2所居住地定点医疗机构，并报医疗保险经办机构备案。

2、异地安置异地工作人员患病在居住地定点医疗机构就诊所发生的医疗费用，由本人或所在单位先行垫付，治疗结束后，由所在单位持参保人员医疗证及病历、有效费用票据、复式处方、住院费用清单等在规定日期到社会医疗保险经办机构进行结算。

(四)转诊转院结算

1、参保人员因定点医疗机构条件所限或因专科疾病转往其它医疗机构诊断治疗的，需填写转诊转院审批表。由经治医师提出转诊转院理由，科主任提出转诊转院意见，医疗机构医保办审核，分管院长签字，报市医保中心审批后，方可转院。

2、转诊转院原则上先市内后市外、先省内后省外。市内转诊转院规定在定点医疗机构间进行。市外转诊转院须由本市三级以上定点医疗机构提出。

3、参保人员转诊转院后发生的医疗费用，由个人或单位先用现金垫付，医疗终结后，由参保人或其代理人持转诊转院审批表、病历证书、处方及有效单据，到医保经办机构报销属于统筹基金支付范围的住院费用。