公路运输合同纠纷的损失应当根据实际情况计算，包括因违约所造成的实际损失和合同履行后可以获得的利益。运输合同中约定了定金和违约金的，一方违约时，对方可以选择适用违约金或者定金条款。

一、既有违约金又有损失赔偿合理吗

既有违约金又有损失赔偿不合理，违约金本身就是给付对方的违约产生的损失赔偿，一般不能同时主张违约金和损失赔偿。

根据《民法典》第五百八十四条规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定，造成对方损失的，损失赔偿额应当相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可以获得的利益；但是，不得超过违约一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违约可能造成的损失。

第五百八十五条规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。

二、股权投资合同违约责任是怎样承担的

1、违约责任承担方式当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。

2、违约责任条款约定违约责任可由合同各方在合同里面作详细约定，对于延迟交付货物或者交付货款的可以约定延迟履行违约金。还可以约定一条总的违约条款：任何一方违反本协议导致本协议无法继续履行的，违约方需赔偿守约方违约金人民币元，该违约金不足以弥补守约方实际损失的，违约方应赔偿守约方所有实际损失。

3、损害赔偿的范围当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定，给对方造成损失的，损失赔偿额应当相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可以获得的利益，但不得超过违反合同一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违反合同可能造成的损失。

4、约定违约金的数额当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。

三、违约金和定金同时存在的情况下如何处理

违约金和定金在同时存在的情况下，对方可以选择适用违约金或者定金条款；定金不足以弥补一方违约造成的损失的，对方可以请求赔偿超过定金数额的损失。

当事人同时约定违约金和定金，但没有约定定金性质的，当事人一方违约，对方一并主张定金和违约金的，法院不予支持；当事人一方违约，对方依据约定的定金性质一并主张解约定金和违约金的，法院应予支持。我国法律规定，买卖合同中既有违约金又有定金条款的，发生违约后，一方只能主张违约金或者定金，不得要求对方同时承担。通常情况下，守约方应该按照对自己最有利的赔偿方案执行。

定金和违约金的赔偿方式：

1、收受定金的一方不履行债务或者履行债务不符合约定，致使不能实现合同目的的，应当双倍返还定金；

2、一方违约时，可以按照合同约定向对方支付一定数额的违约金，也可以按照合同约定的损失赔偿额的计算方法来支付违约金。需要注意的是，定金和违约金不能同时适用，只能选其一。