一般来说，新农合跨省住院报销标准是按照以下比例来算的：乡镇卫生院就医，起付线为100元，报销比例为90%，县级定点医院就医，起付线为200元，报销比例为82%，市级定点医院就医，起付线为500元，那么报销比例为65%，省级定点医院就医，起付线为700元，报销比例为55%；省外非定点医院就医，起付线为1000元，报销比例为45%。

一、新农合异地住院如何报销

依托全省医保网络和设备平台，在各设区市建立新型农村合作医疗信息操作平台，在设区市卫生行政部门成立异地就医费用结算中心，以县为单位统筹进行参合农民住院费用的结算，实现农民群众就医即时报销。在省里建立全省新型农村合作医疗数据备份中心和异地就诊数据交换中心。

不过值得注意是住院才能报销，门诊的不能报。报销需要回老家(参保地)报销时大概需要的手续有：

1、住院病历

2、费用清单

3、住院发票

4、疾病诊断书

5、出院小结

6、身份证、户口本

7、合作医疗本(或证、卡)

8、转院手续或证明(单位打工证明或急诊证明)

不属于新农合报销范围：

(一)非区内定点医院门诊医疗费用(特殊病种门诊治疗费用除外)、未按规定就医、自购药品所产生的费用；

(二)计划生育措施所需的费用，违反计划生育政策的医疗费用；

(三)镶牙、口腔正畸、验光配镜、助听器、人工器官、美容治疗、整容和矫形手术、康复性医疗(如气功、按摩、推拿、理疗、磁疗等)以及各类陪客费、就诊交通费、出诊费、住院期间的其他杂费等费用；

(四)存在第三方责任的情况下，发生人身伤害产生的医药费依法由第三责任方承担，如交通事故、医疗事故、工伤等；

(五)因自杀、自残、服毒、吸毒、打架斗殴等违法行为以及其家属的故意行为造成伤害所产生的医药费；

(六)出国或在港、澳、台地区期间发生的医疗费用；

(七)城镇职工医疗保险制度规定不予报销的药品和项目；

(八)区医管会确定的其他不予报销的费用。

为此，国家计生委发布了《城乡居民基本医疗保险(新型农村合作医疗)跨省就医联网结报定点医疗机构操作规范(试行)》，让农民实现异地住院直接结算。