双方当事人达成刑事和解，被告人会按以下进行处理：

（一）公安机关可以撤案不过，只对于自诉刑事案件可以撤案处理，并且是在自诉人宣告判决前撤回自诉。对于自诉案件以外的公诉案件，立案后是不允许撤诉的。

（二）检察机关可以不起诉对于侮辱诽谤罪，暴力干涉婚姻自由罪、虐待罪和侵占四种自诉案件，如果被害人及其他有告诉权的人不提出告诉，或者提出告诉后又撤回告诉的，人民检察院即会作不起诉处理。

（三）法院应当对被告人从轻处罚注意，这里是法院“应当”从轻处罚，即判决时要适用较轻种类或者较小幅度的处罚，而不是“可以”。最后，犯罪分子符合适用条件的，还将按以下处理：

1、适用非监禁刑，即缓刑;

2、可以减轻处罚;

3、可以免除刑事处罚。所以，根据以上，达成刑事和解后，对犯罪分子会被宽大处理，所以如果有条件的话，可以尽量跟受害人和解，签订刑事和解协议。

一、刑事自诉案件第一审程序有哪些

刑事自诉案件第一审程序有：1、立案。立案一般源于被害人的控告、犯罪人的自首、单位或个人的举报等；2、侦查。侦查，是指公安机关、人民检察院依法进行的专门调查工作和与案件有关的强制性措施；3、审查起诉。人民检察院对侦查终结的自诉案件进行审查，决定是否将该案件提起自诉。《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百一十二条规定，人民法院对自诉案件，可以进行调解；自诉人在宣告判决前，可以同被告人自行和解或者撤回自诉。本法第二百一十条第三项规定的案件不适用调解。人民法院审理自诉案件的期限，被告人被羁押的，适用本法第二百零八条第一款、第二款的规定；未被羁押的，应当在受理后六个月以内宣判。

二、强奸罪还可以私了吗？

根据我国刑法第二百一十二条规定，人民法院对自诉案件，可以进行调解;自诉人在宣告判决前，可以同被告人自行和解或者撤回自诉。强奸罪属于刑法规定的8种重罪之一，属于公诉案件，即使被害人不报案，只要公安机关发现犯罪事实的，也会立案处理。但是根据《中华人民币共和国刑事诉讼法》第二百八十八条、第二百九十条的规定，如果强奸案件情节较轻，可能判处三年以下有期徒刑的，犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪，通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，被害人自愿和解的，双方当事人可以和解，对于达成和解协议的案件，公安机关可以向人民检察院提出从宽处理的建议。人民检察院可以向人民法院提出从宽处罚的建议;对于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚的，可以作出不起诉的决定。人民法院可以依法对被告人从宽处罚。