法院不会认定是分居的情况如下：

1、仍在同一屋檐下生活。由于经济条件的限制，大多数夫妇只有一个住所，或负担不起长期单独租房，当一方提起离婚诉讼时，如果另一方不承认分居事实，他人难以作证，所以法院一般不接受；

2、地理意义上的夫妻异地分居。有些夫妻因为就业等原因不住在同一个地方，所以地理意义上的夫妻异地生活不一定是法律上的分居。法律上的分居指的是夫妻不履行义务。但若生活在不同地方的夫妻之间存在感情不和，也可以构成法律意义上的分居，但必须证明夫妻之间存在感情不和等证据。

根据相关规定，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

法院如何认定夫妻分居

共同生活是夫妻双方的基本权利和义务，如果长期不在一起生活，夫妻关系只是名分。因此，法律规定因感情不和分居满两年，法院应当准予离婚。但是，要注意，必须是因为感情不和导致分居，并且满2年的时间，法院才会予以判离。夫妻分居，包括因感情不和而导致的不在一处居住，不履行夫妻之前的权利、不过夫妻性生活。当然以上事实要用证据证实，或对方承认。如果只有一方另行租房的租赁合同，或是夫妻同在一个屋檐下、一套房子住、事件中是不是分床不好说清，法院也不好认定为分居。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。

经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。