我国法律、法规及司法解释对确认之诉是否适用诉讼时效制度没有明确规定，股权纠纷诉讼适用3年一般民事诉讼时效。

诉讼时效制度归根结底是为了督促当事人及时行使权利，以维护社会稳定，避免权利义务关系长期处于不稳定状态。股权作为一种特殊的权利，既有物权性质，亦有债权性质，但又不同于一般的物权或债权。

法律依据：《最高人民法院关于适用中华人民共和国公司法若干问题的规定（三）》第二十三条

当事人依法履行出资义务或者依法继受取得股权后，公司未根据《公司法》第三十一条、第三十二条的规定签发出资证明书、记载于股东名册并办理公司登记机关登记，当事人请求公司履行上述义务的，人民法院应予支持。

一、股东身份如何认定的？

股东身份认定一是通过工商登记查询、二是公司内部有股东名册，另外公司会向股东签发出资证明书，以上三种途径均可以证明股东身份。

（一）公司章程

公司章程是公司组织和活动的基本规则。根据我国公司法规定，有限责任公司必须在章程中记载股东的名称或姓名，这是章程的绝对必要记载事项，股东应当在章程上签名盖章，在公司设立时应将章程提交公司登记机关核准。并且，在发生股权转让而改变股东名称时，也需修改公司章程。公司章程对内具有确定股东及其权利义务、对抗股东间其他约定的效力。其对外具有公示的效力，是相对人据以判断公司股东的依据。因此公司章程对于股东身份的认定具有决定意义。特别是在股东之间就股东身份及其权利义务发生争议时，公司章程在诸形式要件中具有优先的效力。

（二）工商登记

工商登记对于股东身份认定有何意义？由于工商登记对股东身份认定具有证权功能，具有公示力和公信力，在涉及公司股东与第三人的关系时，工商登记对股东身份认定具有优先的效力。登记的股东可以以工商登记作为证明股东资格并对抗第三人的表面证据。另一方面，第三人基于工商登记的公信力，有权要求登记的股东依登记内容对外承担相应的责任。

（三）股东名册

股东名册是公司所置备的反映股东现状的有关账薄。理论界普遍认为，股东名册并不具有设权效力。因为股东名册不具有确定力，对股东名册可以进行主动修正和申请修正。从我国的规定和实践来看，我国现行公司法规定股东名册是在公司成立后备置，且我国公司法未明确规定其效力和功能。同时，股东名册只是公司出具和控制的股权证明形式，易出现不规范的随意行为，实践中有的公司甚至不设股东名册，因此，其不具有工商登记所具有的公示力和公信力。

所以，股东名册应视为证明股东资格的表面证据，是股东行使股东权的形式准据，其对于股东身份认定的意义，具有形式上的推定力。股东可以以股东名册的登记对抗公司，公司也可在召集股东会、分配利润等事务中依股东名册的记载确认公司股东身份；但其对外不具有对抗性。在当前审判实践中，股东名册只是对于确定股东与公司之间的内部关系具有形式上的意义，但对于确定股东身份的取得无直接的准据价值。

（四）出资证明书

出资证明书，又称股单，是有限责任公司成立后，由公司出具的确认股东已按章程规定的出资额足额缴纳的书面凭证。从出资证明书的特点看，其是由公司成立后签发给出资股东的；公司成立后不待其签发出资证明书，股东即具备了股东身份，享有股东权利，而如果公司怠于签发，股东也应有提出请求的权利。同时我国公司法并未规定股份转让后，更改出资证明书的程序要件，这样在实践中存在着实际股东身份和出资证明书记载的不一致。因此，出资证明书不是物权性凭证。并不能直接证明投资人与公司之间的成员关系，投资人并不能仅以出资证明书向公司主张股东身份和股东权利。因此，出资证明书在股东身份认定中没有决定性的效力，其形式上的推定力甚至小于股东名册。