最好不要注销。在公司涉及的债权债务关系还在法院诉讼期间，若公司进行注销登记，则无法保证对该案所涉及的债权债务关系进行合理的清算和处理。债权人无法及时依法参与到债权分配中，直接导致债权人的权益难以实现。此外，由于诉讼期间公司被注销登记导致其丧失独立法人资格，即无法作为合法的诉讼主体参与到诉讼中，因此将面临诉讼主体变更问题。

一、什么是公司清算

公司的清算，是指在公司解散时，为终结公司作为当事人的各种法律关系，使公司的法人资格归于消灭，而对公司未了结的业务、财产及债权债务关系等进行清理、处分的行为和程序。

公司法人治理结构的建立是人类社会自步入商品经济以来最伟大的创举，是促进社会经济发展的动力。由于公司法人制度的设立，投资者可以在降低投资风险的同时出资设立公司或者参股投资。公司清算是公司法人制度必不可少的环节。这一环节不仅保护了股东的权益、而且保护广大债权人的权益，是公司法人制度存在的基石。

公司清算是基于公司面临终止的情况下发生的。公司终止的原因有两种，一种是公司的解散，另一种是公司的破产，即公司基于宣告破产而终止。这两种情况下都会引起公司的清算，只是清算组织和清算程序存在不同。公司清算

公司的清算是负有公司清算义务的主体按照法律规定的方式、程序而为的行为。在公司的清算中，明确公司清算的义务主体尤为重要。公司的清算主体应为基于对公司的资产享有权益的义务主体。

我国《公司法》即规定有限责任公司的清算组由股东组成，股份有限公司的清算组由董事或者股东大会确定的人员组成。公司清算的范围为公司的出资、资产、债权、债务的审查。

公司清算的目的在于使得公司与其它社会主体之间产生的权利和义务归于消灭，从而为公司的终止提供合理依据。公司的终止涉及到众多利益主体的切身利益，必须对相关权利义务予以处置和解决。

因此，只有在对公司清算后，才能使得相关权利义务得以消灭和转移，公司才能最终终止。

公司清算可按清算程序不同分为破产清算与非破产清算。清算需要出具《公司注销清算报告》，样本见参考资料《公司注销清算报告样本》。

二、公司被吊销营业执照能否恢复

吊销营业执照并不是企业法人立即消灭的程序，企业经营权的再行恢复不是没有法律可能，且也是有法律依据的。正因为如此，吊销并没有剥夺企业法人的民事主体资格，而只是剥夺了其生产经营权，实质上是对企业法人的民事权利能力和民事行为能力的一种限制，是将其经营范围限制在清算活动之内，包括以自己的名义起诉和应诉。只不过此时的公司是受到一定限制的，正如自然人中限制民事行为能力人在死亡前的民事主体资格不能被剥夺一样，企业法人在因违法吊销营业执照后其民事主体资格同样不能被剥夺。

企业法人主体资格的消灭，必然要经过行政权才能消灭，但消灭的最终方法是＂注销＂而不是＂吊销＂。当这个程序依法经过清算，进行注销登记并经公告后，企业的法人资格才归于消灭，企业法人的注销是我国法定消灭法人主体资格的最终方法。未被注销之前，企业法人对其债务应当独立承担民事责任。作为法人主体资格内涵内容的诉讼主体资格依然存在，有权以自己的名义主张权利，维护自身的合法权益，同时也应当以自己的名义履行义务，保证债权人的利益不受侵犯。