(1)权利所有人的对象不同特殊标志的权利所有人是指经国务院批准举办的全国性和国际性的文化体育、科学研究及其他社会公益活动的组织者或筹备者。

注册商标的权利所有人是商品的生产者或经营者。

(2)使用的目的不同特殊标志的使用目的是将所募集的资金，用于特殊标志所服务的社会公益事业，取之于民，用之于民。

注册商标的使用目的是商品的生产者或经营者为了出售自己的商品，为了盈利，并区别于其他商品生产者或经营者的商品，吸引消费者。

(3)使用及保护的范围内不同特殊标志可以使用在与其公益活动相关的所有商品或服务项目上。

注册商标限定使用在核定使用的商品项目上，并在该范围内受到保护。

(4)时效性不同特殊标志的有效期为4年。需要延长期限的，由国务院工商行政管理局商标局根据实际情况和需要决定。

注册商标的有效期为10年。期满后可以续展注册，每次续展注册的有效期为10年，而且可以无限期地重复续展。

(5)适用的法律不同我国的《特殊标志管理条例》(1996年7月13日国务院公布)是管理特殊标志的基本行政法规。

我国的《商标法》(2001年10月27日第二次修订版)是管理商标的基本法律。

在特殊标志所有人授权许并签定书面许可使用合同的情况下，特殊标志使用人可以将被许可的特殊标志与使用人的注册商标使用在同一商品或服务上。

一、知识产权对特殊标志的保护

依据《特殊标志管理条例》

第三章特殊标志的使用与保护

第十三条特殊标志所有人可以在与其公益活动相关的广告、纪念品及其他物品上使用该标志，并许可他人在国务院工商行政管理部门核准使用该标志的商品或者服务项目上使用。

第十四条特殊标志的使用人应当是依法成立的企业、事业单位、社会团体、个体工商户。

特殊标志使用人应当同所有人签订书面使用合同。

特殊标志使用人应当自合同签订之日起1个月内，将合同副本报国务院工商行政管理部门备案，并报使用人所在地县级以上人民政府工商行政管理部门存查。

第十五条特殊标志所有人或者使用人有下列行为之一的，由其所在地或者行为发生地县级以上人民政府工商行政管理部门责令改正，可以处5万元以下的罚款；情节严重的，由县级以上人民政府工商行政管理部门责令使用人停止使用该特殊标志，由国务院工商行政管理部门撤销所有人的特殊标志登记：

(一)擅自改变特殊标志文字、图形的；

(二)许可他人使用特殊标志，未签订使用合同，或者使用人在规定期限内未报国务院工商行政管理部门备案或者未报所在地县级以上人民政府工商行政管理机关存查的；

(三)超出核准登记的商品或者服务范围使用的。

第十六条有下列行为之一的，由县级以上人民政府工商行政管理部门责令侵权人立即停止侵权行为，没收侵权商品，没收违法所得，并处违法所得5倍以下的罚款，没有违法所得的，处1万元以下的罚款：

(一)擅自使用与所有人的特殊标志相同或者近似的文字、图形或者其组合的；

(二)未经特殊标志所有人许可，擅自制造、销售其特殊标志或者将其特殊标志用于商业活动的；

(三)有给特殊标志所有人造成经济损失的其他行为的。

第十七条特殊标志所有人或者使用人发现特殊标志所有权或者使用权被侵害时，可以向侵权人所在地或者侵权行为发生地县级以上人民政府工商行政管理部门投诉；也可以直接向人民法院起诉。

工商行政管理部门受理特殊标志侵权案件投诉的，应当依特殊标志所有人的请求，就侵权的民事赔偿主持调解；调解不成的，特殊标志所有人可以向人民法院起诉。

第十八条工商行政管理部门受理特殊标志侵权案件，在调查取证时，可以行使下列职权，有关当事人应当予以协助，不得拒绝：

(一)询问有关当事人；

(二)检查与侵权活动有关的物品；

(三)调查与侵权活动有关的行为；

(四)查阅、复制与侵权活动有关的合同、帐册等业务资料。