因为工程款与质量责任是两个不同性质的款项，乙方施工完毕后如果经过竣工验收或交付使用，那么甲方应该支付工程款。

至于工程质量问题，属于甲方另行主张的权利。何况经过了竣工验收的工程，乙方承担的是质量问题的修复责任；交付的工程，乙方只对主体结构的质量问题承担责任。这些都需要甲方证明。

如果工程没有经过竣工验收，也没有交付，甲方扣款不承担违约责任。因为甲方有权不支付工程款，或者属于支付工程款条件不成就。

一、二次贯穿性裂缝赔偿标准是多少

没有具体的赔偿标准，一般质量问题只负责保修，严重的话，走法律程序。根据最高人民《关于审理商品房买卖合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》的规定，商品房质量问题由轻到重通常可以分为以下三种情1．属于保修范围内的一般质量问题。如墙体或地坪轻微开裂、空鼓，屋顶或墙壁局部漏水、渗水等问题。购房人可以根据《解释》第十三条第二款规定：“交付使用的房屋存在质量问题，在保修期内，出卖人应当承担修复责任；出卖人拒绝修复或者在合理期限内拖延修复的，买受人可以自行或者委托他人修复。修复费用及修复期间造成的其他损失由出卖人承担。”也就是说，开发商必须整改。如果拖延不决，开发商不但要承担必要的费用，还必须进行赔偿。2．已经严重影响正常居住使用的质量问题。《解释》第十三条第一款规定：“因房屋质量问题严重影响正常居住使用，买受人请求解除合同和赔偿损失的，应予支持。”是否已构成“严重影响正常居住使用”，在司法实践中要通过相关部门鉴定，由根据案情综合评定。3．房屋主体结构质量不合格的问题。《解释》第十二条规定：“因房屋主体结构质量不合格不能交付使用，或者房屋交付使用后，房屋主体结构质量经核验确属不合格，买受人请求解除合同和赔偿损失的，应予支持。”如有些业主入住后，发现现浇板出现贯穿性的裂缝，直接影响居住者的安全。业主可以要求开发商出具经房屋安全鉴定机构认可的整改方案。整改结束后，还应请房屋安全鉴定机构进行复检。另外，需要提醒购房人，在办理商品房交接入住手续时，应要求开发商出示该楼盘的《建筑工程竣工验收备案表》，查验该工程是否经验收合格。

二、要如何理解竣工日期

竣工日期是指合同约定的建设项目完工之日。对竣工日期，实务中对此问题却意见不一，存在争议。因为竣工日期与工期是否违约，支付工程款的起算时间，以及工程款计息时间都是紧密联系在一起的，二者可谓关系甚大。在工程结束时，竣工日期关乎到工资等，因此准确把握竣工日期是十分重要的。

关于竣工日期的确定，我国建设工程施工合同示范文本中规定工程竣工验收通过，承包人送交竣工验收报告的日期为实际竣工日期。工程按发包人要求修改后通过竣工验收的，实际竣工日期为承包人修改后提请发包人验收的日期。如果施工合同无约定或者约定不明的，则适用法定原则。