租赁店铺的税费以租金为基础计算，增值税为月租金收入的3%，城建税为增值税的1%或5%或7%，教育费附加为增值税的3%，地方教育附加为增值税的1%，房产税为月租金收入的4%，土地使用税为每平方米土地年税额除以12个月乘以占地面积，印花税为月租金收入的0.1%×0.001。

一、房租收入个税

1、对于个人出租而言，出租非住房所要缴纳的房屋租赁税主要有房产税、营业税、城建税和教育费附加、个人所得税和印花税，其中房产税是以租金收入的１２％计算缴纳；营业税以租金收入的５％计算缴纳；城建税是按实际缴纳的营业税乘以城建税率（根据地方的不同一般分为７％、５％、１％三档）；教育费附加是实际缴纳的营业税乘以３％计算缴纳。

个人所得税按财产租赁所得，不超过4000的减除费用800；4000以上的减除20％的费用，其余额为应该纳税的金额，然后再按20％的税率计算缴纳；印花税按财产租赁合同租赁金额的千分之一贴花。税额不足1元，按1元贴花。

２、而对于个人出租住房：房产税则是以租金的4％计算缴纳，营业税是3％的税率基础上减半计算缴纳，个税是个人出租住房取得的所得暂减按10％的税率征收个人所得税。财产租赁所得，每次收入不超过4000元的，减除费用800元；4000元以上的，减除20％的费用，其余额为应纳税所得额。

个人出租住房是免征印花税的，城建税是按实际缴纳的营业税乘以城建税率（根据地方的不同一般分为７％、５％、１％三档），教育费附加是实际缴纳的营业税乘以３％计算缴纳。

二、房屋租赁发票几个点

房屋租赁发票税点包括：

1、房产税：以租金收入12%计算缴纳。

2、营业税：以租金收入的5%计算缴纳。

3、城市维护建设税及教育费附加：以实际缴纳营业税税额乘以城建税率和教育费附加率3%计算缴纳。

4、个人所得税：按财产租赁所得，每次收入不超过4000元的，减除费用800元，4000元以上的，减除20%的费用，其余额为应纳税所得额，税率是20%。

5、印花税：按财产租赁合同租赁金额的千分之一贴花。税额不足1元，按1元贴花。

三、开房屋租赁发票税点

房屋租赁发票税点是：印花税为租金的0.001%；房产税为租金的4%；增值税为租金的3%；城建税为增值税的1%、5%、7%；教育费附加为增值税的3%；地方教育附加为增值税的1%。承租人应当依照房屋租赁合同的约定交纳房租，出租人收费后开具抬头为该承租人名称的房屋租赁发票，或由地税局代为开具。